61、数据库技术在序列比对与查询优化中的应用

数据库技术在序列比对与查询优化中的应用

在数据库技术的应用领域，生物序列比对以及用户偏好查询的优化是两个重要的研究方向。下面将详细介绍相关的测试结果、方法及性能分析。

生物序列比对测试结果

在生物序列比对的研究中，针对不同的隐马尔可夫模型（HMM）进行了测试，具体结果如下表所示：
| HMM | runtime hmmsearch（秒） | T | Filtering time（秒） | n | sens100 | sens60 | sens40 | sens20 | selectivity |
| — | — | — | — | — | — | — | — | — | — |
| rrm | 92 | 1 | 7.2 | 7 | 64% | 85.4% | 96.7% | 99% | 1.04% |
| rrm | 92 | 1 | 7.2 | 6 | 74.8% | 93.1% | 98.9% | 100% | 3.9% |
| rrm | 92 | 1 | 7.2 | 5 | 85.8% | 98.9% | 100% | 100% | 16.6% |
| globins50 | 166 | 1 | 3.3 | 7 | 75.7% | 100% | 100% | 100% | 0.11% |
| globins50 | 166 | 1 | 3.3 | 6 | 81.4% | 100% | 100% | 100% | 0.2% |
| globins50 | 166 | 1 | 3.3 | 5 | 82.6% | 100% | 100% | 100% | 1.2% |
| globins50 | 166 |