多线程与webserice应用之怪现象

最近一个项目，项目功能分为TMS(任务管理服务器)，TES（任务执行服务器），通过TMS来接受任务创建及管理 调度查询功能。TMS又分主用TMs和备用TMs。服务可以单独部署，也可以部署有一个服务中。分开部署则相互间以webservice（axis2）访问。

测试过程中，在分开部署测试时出现一怪问题：
主用以myeclipse启动（6.5），备用在tomcat中启动，运行任务时，执行部分任务后没多久就会出现webservice超时异常。

但如果主用是tomcat启动，则无论多久也不出现这一异常。

不知是否有高手碰到这一问题，有的请赐教。