实用算法实现-第8篇 后缀树和后缀数组 [1简介]

实用算法实现-第 8 篇 后缀树和后缀数组 [2 最长公共子串] 8.3    最长公共子串 求N个串的最长公共子串,可以转化为求一些后缀的最长公共前缀的最大值,这些后缀应分属于N个串。设N个串分别为S1,S2,S3,…,SN。 具体方法如下: 1. 建立字符串S,使得S = S1[P1]S2[P2]S3…SN-1[PN-1]SN。其中P1,P2,…,PN-1应为不同的N - 1个不在字符集中的字符,作为分隔符。插入分隔符的目的是为了防止S的后缀的公共前缀 阅读详情

8.1    后缀树

一棵后缀树包含一个指定文本的所有后缀,对于在一个长度为N的文本中查找一个长度为M的子字符串,一个后缀树仅仅需要M次比较,而这个比较次数是查找该字符串所需要的最小比较次数。

后缀树有以下特征:一条边可以表示文本的任何非空子串,每个非终端节点,除了根节点,必须至少有两个孩子边,兄弟边表示的子串必须开始于不同的字符。

ababa所对应的后缀树如下所示:

后缀树可以解决很多复杂的字符串编程问题,包括:

1. 查询字符串S是否包含子串S1。主要思想是:如果S包含S1,那么S1必定是S的某个后缀的前缀;又因为S的后缀树包含了所有的后缀,所以只需对S的后缀树使用和Trie相同的查找方法查找S1即可。使用后缀树实现的复杂度同流行的KMP算法的复杂度相当。

2. 找出字符串S的最长重复子串S1。比如abcdabcefda里abc同da都重复出现,而最长重复子串是abc。

3. 找出字符串S1和S2的最长公共子串。注意最长公共子串(Longest CommonSubstring)和最长公共子序列(LongestCommon Subsequence, LCS)的区别:子串(Substring)是串的一个连续的部分,子序列(Subsequence)则是从不改变序列的顺序,而从序列中去掉任意的元素而获得的新序列;更简略地说,前者的字符的位置必须连续,后者则不必。比如字符串acdfg同akdfc的最长公共子串为df,而他们的最长公共子序列是adf。LCS可以使用动态规划法解决。

4. Lempel-Ziv-Welch (LZW)无损压缩算法。LZW算法的基本原理是利用编码数据本身存在字符串重复特性来实现数据压缩,所以一个很好的选择是使用后缀树的形式来组织存储字符串及其对应压缩码值的字典。在UNIX COMPRESS程序中使用的LZW压缩的源程序可以在

增强后缀数组替代后缀树 后缀树有一个缺点就是很费空间。那么能不能用后缀数组来实现这样的功能呢,当然是可以的,那就是增强后缀数组(enhanced suffix arrays)。增强后缀数组能模拟后缀树的大部分的结构,所谓增强后缀数组就是在后缀数组的基础上加了一些额外的信息,那就是child table。 立即下载

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