新型作物种植模式优化方法与蛋白质折叠问题算法研究
在农业生产和生物计算领域,分别存在作物种植模式优化(CPO)和蛋白质折叠问题(PFP)两大难题。本文将为大家介绍针对这两个问题的创新解决方法,包括GenSRT方法在CPO问题上的应用,以及MultiQuenching Annealing(MQA)算法在PFP问题上的探索。
作物种植模式优化(CPO):GenSRT方法
在作物种植中,确定最佳的种植模式对于提高收益至关重要。GenSRT方法结合了回归树(RT)和遗传算法(GA),旨在解决CPO问题,实现更高的净收入。
1. 回归树与多产量输出
对于作物种植中的变量,如播种面积(Ai)和灌溉水深(IWDi),往往不是单一值,而是存在一个取值范围。以图1中的RT为例,假设播种面积约束为20 ≤ Ai ≤ 60公顷,灌溉水深为100毫米,1月温度为8 ºC。根据回归树,在20.925 - 52.185公顷的播种面积下,预计产量为12.77吨/公顷;在52.185 - 60公顷的范围内,预计产量为14.025吨/公顷。
为了获取产量及其相关的子范围,GenSRT实现了一个递归过程,通过深度优先搜索(DFS)遍历回归树,得到满足指定约束的产量列表。以下是获取产量的伪代码:
Input: croptree (a regression tree), constList (a list of constraints)
Output: yieldList (a list of yields and its associated sub-constraints)
func
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