12、网格服务与领域本体助力生物医学研究

网格服务与领域本体助力生物医学研究

1. 引言

随着并行和分布式计算的集成发展，以及网络带宽的提升，网格计算为分布式计算带来了新的维度。网格能够提供数据管理功能，通过跨机构整合信息和资源，实现对分布式资源的访问，其核心在于资源整合与协作。

生物医学领域具有分布式特点，涉及大量实验和观测数据的存储与分析。互联网使得大量知识得以共享，但信息源具有自主性且不断扩展，各研究领域也有自己的数据库。因此，生物医学领域内及不同领域间的信息共享至关重要，需要整合不同来源的数据以满足用户需求。

目前，生物医学面临两大挑战：一是管理现有信息，二是从大量数据中提取有用信息。同时，多学科团队需要在不同地理位置进行协作，有时还需关联不同领域的信息以形成证据网络。传统技术和方法难以应对信息资源的自主性和异构性，而网格服务和本体技术的结合为解决这些问题提供了新途径。

2. 相关工作

基于本体的生物信息学工作包括Riboweb本体、基因本体（GO）和TAMBIS本体，L&C的LinkBase®和统一医学语言系统（UMLS）则用于支持人类疾病研究。
- TAMBIS本体 ：可让生物学家通过通用查询接口对多个外部数据库进行查询。
- Riboweb本体 ：对研究核糖体相关疾病的科学家有帮助，但不支持研究其他众多疾病。
- 基因本体 ：提供生物体中所有基因的信息。
- LinkBase® ：包含大量知识实体，通过LinKFactory®维护一致性。
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