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RSS订阅原创 不同版本anndata的h5ad文件读取, 使用scipy.sparse
这个转换没有保留anndata原有的比较好的结构，所以只适合小规模、少量数据，如果anndata有很多obs var等信息，还真不知道怎么处理比较好。找了找没有比较合适的方式，还是偷懒一个一个转成npz格式，再在旧版本里读取转成anndata吧。之后在旧版本里读取就行了，再视情况看要不要转回anndata。
2023-12-25 02:13:46
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原创 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.29‘ not found
找到包含报错所需的GLIBCXX版本的libstdc++文件后，将这个文件的目录记下，在terminal中使用conda环境中的python运行py文件前，先将其上一级目录添加到LD_LIBRARY_PATH。这会列出许多在conda环境中的位置、usr等目录的位置，关注我们自己的conda环境中的该文件位置，如我的系统中有如下文件。当然也可以把这个命令写进bash脚本、写进.bashrc等，效果应该都是一样的。使用如下命令，可确认该文件是否包含所需的GLIBCXX版本。
2023-11-01 03:25:01
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空空如也
空空如也
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