大规模文本主题建模与人口规模聚类及种族预测
在数据处理和分析领域,我们常常会遇到大规模的数据集,如基因组数据和文本数据。针对不同类型的数据,有不同的处理和分析方法。本文将围绕人口规模聚类与种族预测,以及大规模文本主题建模展开详细介绍。
人口规模聚类与种族预测
在处理大规模基因组数据集时,我们可以借助一些大数据工具,如 Spark、H2O 和 ADAM。具体步骤如下:
1. 应用 Spark 基于 K - means 算法 :对 1000 个基因组项目分析中的遗传变异数据进行处理,旨在实现群体规模上的基因型变异聚类。
2. 使用 H2O 基于 DL 算法和 Spark 基于随机森林模型 :预测地理种族。
3. 安装和配置 H2O 用于 DL :这部分知识在后续分析中会有重要作用。
4. 使用 H2O 计算变量重要性 :以此来选择训练集中最重要的特征。
在完成模型训练后,我们还需要对模型的性能进行评估。以下是计算测试数据的分类准确率、精确率、召回率、F1 度量和误差的代码:
val accuracy = evaluator1.evaluate(predictions)
val precision = evaluator2.evaluate(predictions)
val recall = evaluator3.evaluate(predictions)
val f1 = evaluator4.evaluate(pr
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