[搬家]DCMTK的编译总结

DCMTK库交叉编译移植到ARM流程 阅读详情

最近因为项目原因,突然要我熟悉Dicom协议,之前听都没听说过的,在Google一番后,发觉这个水实在太深了,那个协议看着和天书也差不多少了,而且七七八八也下了一些开源的库啊,软件什么的,但一个对协议都一知半解的人咋能看懂呢?这里非常感谢一个台湾人的一篇Blog(http://blog.chinson.idv.tw/2008/07/dcmtk-for-visual-c-2005.html),还有就是PACS专家网(http://www.pacser.net),还有通过Google搜索到不少宝贝,哦,还有重要的《基于DCMTK的DICOM相关程序编写攻略》这篇文章,让我大概有了一个学习的方向。不过在学习过程中,DCMTK的编译还确实是个不大不小的问题,反正我是搞了个通宵,最后就是发现CMAKE的版本问题,瞬间不知道是不是该高兴。

下面我还是详细的说说编译的过程吧,从一个菜鸟的角度,也希望可以帮助到更多像我这么菜的人,呵呵

关于DCMTK的定义以及背景什么的就请大家Google吧,这里我只说说编译的事情。

不说别的,先把需要的东西下载下来,包括源代码,支持库以及CMake(生成工具),前两个的下载地址:http://www.dcmtk.org/dcmtk.php.en

在这个网址上只需要下如下两个包

这么就是DCMTK的源代码和需要的支持库了,现在菜已经有了,就差炒菜的锅和铲了,呵呵,那就是大名鼎鼎的CMAKE工具了,下载网址是http://www.cmake.org/cmake/resources/software.html,这里记得一定要下载2.4这个版本,不要下载2.6版本的(现在的代码对2.6版本支持的不好),还是放上一张图吧,以免弄错了

至此,需要下载的内容都已经搞定了,下面就将DCMTK和支持库都解压到一个指定的目录即可,解压完的效果如图:

下面要修改一下CMakeLists.txt这个文件,他就在dcmtk-3.5.4这个文件夹的根目录,其实修改的内容很简单就是将MTd替换为MDd一级MT替换为MD,修改后保存即可,至此前期的准备工作都已经做好了,下面就开始正式的编译了。。。

在编译之前我们首先要通过CMake工具生成我们需要的项目,关于CMake的一些介绍以及为什么这么麻烦的还要在生成一下的问题还请大家Google一下,就不在这里浪费时间了。

要使用CMake之前可以将其解压至任何一个文件夹,然后去bin目录下双击CMakeSetup.exe即可,主界面如下:

首先在Where is the source code和Where build the binaries的里选择刚才解压的DCMTK的代码和支持库,然后点击Configure按钮,选择使用的编译工具(我现在还是比较习惯VS2005的),具体如下图

选择好编译环境后,此时CMake可以检测出文件夹内需要编译的文件,如下图

这里要注意图中红色框的标示的地方都需要设置为off,这些外部库是不需要编译的。处理好之后,然后再点击一次Configure按钮之后在点击OK即可,在最底部会有完成度的提示,执行完成后,软件会自动关闭,此时查看dcmtk的文件夹内会多出vs2005的解决方案文件、和ALL_BUILD项目、INSTALL的项目和ZERO_CHECK项目,正常完成后该文件夹内如下:

然后,双击dcmtk.sln,进入到VS2005,选择ALL_BUILD项目,选择生成,就会对整个DCMTK解决方案进行编译并生成,具体如下图:

这时候可以休息一下,喝杯茶什么的,需要编译一会的,完成后,会提示有一个项目被跳过,其他项目都编译成功,被跳过的那个项目就是INSTALL项目的,这个时候在生成一下即可,好了,总算大功告成了,什么?我们的成果在哪?去看看你刚才放DCMTK代码和支持库的那个目录吧,看有没有多一个文件夹叫dcmtk-3.5.4-win32-i386?恩,恭喜,恭喜,这个就是你编译出来的,里面的bin目录放了一大堆很好的工具,而且代码都有,要好好学习的,include文件就不说了,里面都是后面要用的头文件,lib文件全部都是库文件了,好了,DCMTK的编译就结束了,但DCMTK的学习才刚刚开始,大家一起努力吧!

如果上面有什么错漏请及时告诉我,以免误导了别人就不好了,另外在编译过程中有什么问题也可以提出来,我一定尽全力帮助,我的E-Mail:changyu496@gmail.com

谢谢大家!

http://blog.youkuaiyun.com/changyu198609/article/details/4311086

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B. Palm", title = "Prediction as a candidate for learning deep hierarchical models of data", year = "2012",}```Contact: rasmusbergpalm at gmail dot comDirectories included in the toolbox-----------------------------------`NN/` - A library for Feedforward Backpropagation Neural Networks`CNN/` - A library for Convolutional Neural Networks`DBN/` - A library for Deep Belief Networks`SAE/` - A library for Stacked Auto-Encoders`CAE/` - A library for Convolutional Auto-Encoders`util/` - Utility functions used by the libraries`data/` - Data used by the examples`tests/` - unit tests to verify toolbox is workingFor references on each library check REFS.mdSetup-----1. Download.2. addpath(genpath('DeepLearnToolbox'));Example: Deep Belief Network---------------------```matlabfunction test_example_DBNload mnist_uint8;train_x = double(train_x) / 255;test_x = double(test_x) / 255;train_y = double(train_y);test_y = double(test_y);%% ex1 train a 100 hidden unit RBM and visualize its weightsrand('state',0)dbn.sizes = [100];opts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;opts.momentum = 0;opts.alpha = 1;dbn = dbnsetup(dbn, train_x, opts);dbn = dbntrain(dbn, train_x, opts);figure; visualize(dbn.rbm{1}.W'); % Visualize the RBM weights%% ex2 train a 100-100 hidden unit DBN and use its weights to initialize a NNrand('state',0)%train dbndbn.sizes = [100 100];opts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;opts.momentum = 0;opts.alpha = 1;dbn = dbnsetup(dbn, train_x, opts);dbn = dbntrain(dbn, train_x, opts);%unfold dbn to nnnn = dbnunfoldtonn(dbn, 10);nn.activation_function = 'sigm';%train nnopts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;nn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.10, 'Too big error');```Example: Stacked Auto-Encoders---------------------```matlabfunction test_example_SAEload mnist_uint8;train_x = double(train_x)/255;test_x = double(test_x)/255;train_y = double(train_y);test_y = double(test_y);%% ex1 train a 100 hidden unit SDAE and use it to initialize a FFNN% Setup and train a stacked denoising autoencoder (SDAE)rand('state',0)sae = saesetup([784 100]);sae.ae{1}.activation_function = 'sigm';sae.ae{1}.learningRate = 1;sae.ae{1}.inputZeroMaskedFraction = 0.5;opts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;sae = saetrain(sae, train_x, opts);visualize(sae.ae{1}.W{1}(:,2:end)')% Use the SDAE to initialize a FFNNnn = nnsetup([784 100 10]);nn.activation_function = 'sigm';nn.learningRate = 1;nn.W{1} = sae.ae{1}.W{1};% Train the FFNNopts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;nn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.16, 'Too big error');```Example: Convolutional Neural Nets---------------------```matlabfunction test_example_CNNload mnist_uint8;train_x = double(reshape(train_x',28,28,60000))/255;test_x = double(reshape(test_x',28,28,10000))/255;train_y = double(train_y');test_y = double(test_y');%% ex1 Train a 6c-2s-12c-2s Convolutional neural network %will run 1 epoch in about 200 second and get around 11% error. %With 100 epochs you'll get around 1.2% errorrand('state',0)cnn.layers = { struct('type', 'i') %input layer struct('type', 'c', 'outputmaps', 6, 'kernelsize', 5) %convolution layer struct('type', 's', 'scale', 2) %sub sampling layer struct('type', 'c', 'outputmaps', 12, 'kernelsize', 5) %convolution layer struct('type', 's', 'scale', 2) %subsampling layer};cnn = cnnsetup(cnn, train_x, train_y);opts.alpha = 1;opts.batchsize = 50;opts.numepochs = 1;cnn = cnntrain(cnn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = cnntest(cnn, test_x, test_y);%plot mean squared errorfigure; plot(cnn.rL);assert(er<0.12, 'Too big error');```Example: Neural Networks---------------------```matlabfunction test_example_NNload mnist_uint8;train_x = double(train_x) / 255;test_x = double(test_x) / 255;train_y = double(train_y);test_y = double(test_y);% normalize[train_x, mu, sigma] = zscore(train_x);test_x = normalize(test_x, mu, sigma);%% ex1 vanilla neural netrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);opts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samples[nn, L] = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.08, 'Too big error');%% ex2 neural net with L2 weight decayrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);nn.weightPenaltyL2 = 1e-4; % L2 weight decayopts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samplesnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex3 neural net with dropoutrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);nn.dropoutFraction = 0.5; % Dropout fraction opts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samplesnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex4 neural net with sigmoid activation functionrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);nn.activation_function = 'sigm'; % Sigmoid activation functionnn.learningRate = 1; % Sigm require a lower learning rateopts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samplesnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex5 plotting functionalityrand('state',0)nn = nnsetup([784 20 10]);opts.numepochs = 5; % Number of full sweeps through datann.output = 'softmax'; % use softmax outputopts.batchsize = 1000; % Take a mean gradient step over this many samplesopts.plot = 1; % enable plottingnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex6 neural net with sigmoid activation and plotting of validation and training error% split training data into training and validation datavx = train_x(1:10000,:);tx = train_x(10001:end,:);vy = train_y(1:10000,:);ty = train_y(10001:end,:);rand('state',0)nn = nnsetup([784 20 10]); nn.output = 'softmax'; % use softmax outputopts.numepochs = 5; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 1000; % Take a mean gradient step over this many samplesopts.plot = 1; % enable plottingnn = nntrain(nn, tx, ty, opts, vx, vy); % nntrain takes validation set as last two arguments (optionally)[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');```[![Bitdeli Badge](https://d2weczhvl823v0.cloudfront.net/rasmusbergpalm/deeplearntoolbox/trend.png)](https://bitdeli.com/free "Bitdeli Badge")

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