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RSS订阅原创 基因加性方差、显性方差与上位性方差定义
基因加性方差、显性方差与上位性方差定义第一等位基因：是指位于一对同源染色体相同位置上控制同一性状不同形态的基因。第二表现型值 = 基因型值 + 环境离差（由环境引起的表现型值变化）基因型值可划分为G = A + D + I加性效应（A） ：基因位点内等位基因和非等位基因的累加效应显性效应（D） ：指基因位点内等位基因之间的互作效应上位性效应（I） ：非等位基因之间的相互作用第三表现型方差 = 基因型方差 + 环境方差基因型方差可分为基因加性方差：等位基因间和非等位基因间的累
2020-08-15 19:56:02
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原创 Removed 256 rows containing missing values (geom_violin)
报错小提琴图**Warning message:Removed 256 rows containing missing values (geom_violin).**报错代码**library(“ggplot2”)data <- read.table(“clipboard”,sep="\t",header = T,check.names=F)dim(data)data[1:4,1:2]###转化因子datamale<−factor(datamale <-factor(d
2020-07-03 14:42:22
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原创 Warning message: Removed 35 rows containing missing values (geom_bar).
画柱状图，结果报错，因为y轴范围正常图想变小改变y轴范围，使图好看些scale_y_continuous(expand = c(0,0),limits = c(0,a))##改变后scale_y_continuous(expand = c(0,0),limits = c(0.5,a))报错Warning message:Removed 35 rows containing mi...
2020-04-29 13:53:35
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原创 geom_path: Each group consists of only one observation. Do you need to adjust the group aesthetic?
报错见到这个报错，我百度了一下，好多是建议 group =1但尝试无效1.数据主要就错在 group 的数据类型，他是因子型，但如果想将坐标点连接起来得为数值merge_data$average <- as.numeric(merge_data$average)merge_data$group <- as.numeric(merge_data$group)这样就没...
2020-04-28 17:46:04
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原创 geom_signif 函数自己的错误 ——Warning message:
被两个错误搞了，一天---------以此纪念傻逼的自己，，气死了第一个很傻逼的错误**Computation failed in `stat_signif()`:not enough 'y' observations**这个告诉“Y”那不对，，，，，，，，这个错误最傻逼这个错误就是找不同，，，，，，这是我的错误，也许报错相同但是错误不同compaired <- list(c...
2020-04-22 15:19:11
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原创 R语言分类汇总
R语言分类汇总##加载包library(dplyr)##函数 group_by 制定数据集 data 中针对 type 变量进行分类汇总grou <- group_by(data,type)##summarise函数计算分类结果——sd 标准差，还可计算其他类，分类汇总type_sd <- summarise(grou ,sd(range ,na.rm = T))dat...
2020-04-16 14:43:23
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原创 标准差和标准误的区别
标准差与标准误首先标准误和标准差是有先后的——个人理解先标准差后标准误标准差定义总体各单位标准值与其平均数离差平方的算术平均数的平方根即抽取为n个样本或测量n个结果与其平均值的离差平方算数平方根n个样本相对于其平均值分散程度的一种度量，越小均值越具代表性标准差=方差的开平方标准差公式/若为样本标准差则N=n-1标注误的定义将k次抽取的n个样本，或k次测量得到的n个结果，分别计...
2020-04-16 12:53:47
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原创 混淆矩阵（confusionMatrix）——基于R语言的输出结果理解
混淆矩阵的基本理解以R语言输出结果为例从下图理解混淆矩阵中个字母含义准确度的理解kappa值的理解及P值的理解，，，希望大神指教各参数的解释...
2020-03-21 13:28:48
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原创 R语言——confusionMatrix混淆矩阵结果的提取$
在进行多种方法对比时，常需要将多个结果进行提取保存在excel中，，，，因此如何提取混淆矩阵的各种结果呢——***$***##当我计算一个预测值(pls_predicting)和真值(test$type)的结果对比混淆矩阵时pls.cmx <- confusionMatrix(data = pls_predicting, test$type)pls.cmx输出结果如下当我想提...
2020-03-21 09:36:48
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原创 画光谱图——R语言graphics包matplot等函数
由于前几天一直找如何将光谱图画出，为二分类光谱数据，找了半天，，，，最后在循环的条件下，一条条画完，，，，，，最近在prospectr包中忽然发现matplot等函数数据格式原始数据处理##设置读取数据位置setwd("C:/Users/chengdehe/Desktop/processing")##读取数据data <- read.csv("H3.csv",check.n...
2020-03-20 14:51:06
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原创 光谱预处理——R语言prospectr包
加载R包###加载install.packages("prospectr")library(prospectr)##帮助??prospectr里面会有详细的介绍以自己数据为例##设置读取数据位置setwd(“C:/Users/chengdehe/Desktop/processing”)##读取数据data <- read.csv(“H3.csv”)数据结构...
2020-03-16 19:37:40
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原创 修改ggplot2主题theme_classic
theme_classic应用于ggplot2后无法修改theme其他内容ps今天发现明明自己已经加的theme的修改内容但是无效，半天后发现，，，，注意以下两种代码顺序**1ggplot(plotdata, aes(标线, range,fill=标线)) + geom_boxplot()+ xlab("标线类型")+ ylab("极差")+ theme(l...
2020-03-12 18:57:00
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原创 ggplot中geom_boxplot绘制并列分组箱线图
ggplot中geom_boxplot绘制并列分组箱线图#*转变因子的一部最重要*setwd("。。。。。")data1 <- read.table("clipboard",header=T,sep='\t')####转变为因子，才会显示分组data1$dot<-as.factor(data1$dot)data1$tw_ns<-as.factor(data1$tw_...
2020-03-10 23:29:39
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空空如也
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