ccc_bioinfo的博客

需要做一个感兴趣的基因的测序数据在基因组上的分布profile，deeptools可以解决这个问题，记录一下过程。 1、安装deeptools pip install deeptools 2、准备bw和bed文件 （1）bw bw即样本测序数据的bigwig文件，之前做过，也是用deeptools的bamCoverage就可以实现。 bamCoverage -b sample.bam -o sample.bw （2）bed bed即感兴趣的基因在genome上的位置，我先用10个基因测试，10个基因的en