DNA序列检测源码及实现方法

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本文介绍了如何利用MATLAB进行DNA序列检测,特别是使用Needleman-Wunsch算法进行序列比对,以找出最佳匹配。文章通过读取FASTA格式的DNA序列文件,详细阐述了比对过程并提供了实现代码。

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DNA序列检测源码及实现方法

DNA序列检测是生物信息学中一个重要的研究方向。在实际应用中,需要对大量的DNA序列进行分析和比对,以寻找关键基因片段或者疾病相关的突变。本篇文章将介绍如何利用 MATLAB 实现 DNA 序列的读入、处理以及比对。

首先,我们需要准备两个 DNA 序列文件,这里以 FASTA 格式为例。可以使用记事本等文本编辑器将 DNA 序列复制到文本文件中,以 “.fasta” 为后缀名保存。代码如下所示:

%读取并存储DNA序列文件
file1 = 'sequence1.fasta'; %第一个序列文件
file2 = 'sequence2.fasta'; %第二个序列文件

seq1 =
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