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原创统计学习笔记生物基因组学应用（三）

他这个箭头指向的是原因。贝叶斯图可以看成是马尔科夫链推广到有向图的结果，一般都假定一阶，即与只于前一个结点（即父结）点有直接关系，一般表示都是父结点（xt）指向下一结点(xt+1)，即指向的是导致的结果，或下一个状态。第二，图中表头按照红色修正的标记更好理解一点，家族病史和高血脂对应的是下面第一列的四个 “有，无”，并且圈中应为无。《数学之美》是一部非常不错的书，以连贯的思维勾勒出包括自然语言处理，一直到到第三版增加了比特币密码学合深度学习的原理，可以快速了解一些技术，至少对多年前的人们来说。

2025-03-30 23:41:57 176

原创 python类变量与实例变量小记

可见，如果有xxx类变量的话，self.xxx变量所指的是哪一个取决于__init__()函数中是否有self.xxx的声明，如果没有，则这个self.xxx就是类变量本身。

2024-09-22 20:50:56 273

原创统计学习笔记生物基因组学应用（二）

这篇文章给了一个实际的例子，用神经网络预测一段序列当中的motif, 分割成2000小段序列，每段50bp，实验已知每段是否包含motif 比如增强子,标记为0、1，分成训练集和预测集进行验证，最后解释，实际真实的序列是（CGACCGAACTCC。先对数据编码，一般对四种碱基编码为：A [1,0,0,0],T [0,0,1,0],C [0,1,0,0] ,G [0,0,0,1]#arrays[0], arrays[1], arrays[2]进行堆叠，所以结果与原始数组一样。

2024-06-08 22:43:56 722

原创数据拟合平滑样条问题

R里面有平滑样条函数，一条命令就好了smooth.spline()比如我们做基因组测序数据时需要将dosage对GC进行校正，那么在R中做GC校正就相当简单：d <- read.table(flex, colClasses = c("numeric", rep("NULL",4), "numeric", "numeric"))#其中设定为numeric的三列为纯数字染色体号、覆盖...

2019-10-30 00:07:01 1699

原创恢复正在运行的脚本到文件

当你的脚本已经提交后台运行，而你却误删了该脚本，不要惊慌，只要他还在运行就能恢复出来。很简单首先ps aux|grep jiaoben.shbioinfo 1636 0.0 0.0 6380 692 pts/1 S+ 16:38 0:00 grep jiaoben.shbioinfo 80790 0.0 0.0 9236 1224 p

2013-06-25 16:46:55 734

原创 win7下安装linux双系统故障排除

原先是win7的系统，准备做成win7 linux双系统，于是随便在网上找了个教程开始安装http://www.linuxidc.com/Linux/2012-11/73500p2.htm下载easybcd2.2 ubuntu12.10 iso镜像文件。刻录了ubuntu(似乎无法从iso硬盘镜像安装）安装完ubuntu，安装过程没问题,重启准备看看双系统，重启之后发现引导界面变成了g

2013-05-16 21:21:52 1132