java实现第七届蓝桥杯碱基

该博客介绍了一道关于第七届蓝桥杯编程竞赛的题目,涉及生物学家对DNA序列的研究。问题核心在于寻找至少在m个物种中出现的长度为k的连续碱基序列,即共性序列,并计算这样的序列有多少种。输入包括物种数量n、序列出现次数m和序列长度k,输出是满足条件的序列元组数量。样例输入和输出已给出,数据规模和约定也做了详细说明。代码要求遵循特定的限制条件,如内存消耗和运行时间。

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碱基

题目描述
生物学家正在对n个物种进行研究。
其中第i个物种的DNA序列为s[i],其中的第j个碱基为s[i][j],碱基一定是A、T、G、C之一。
生物学家想找到这些生物中一部分生物的一些共性,他们现在关注那些至少在m个生物中出现的长度为k的连续碱基序列。准确的说,科学家关心的序列用2m元组(i1,p1,i2,p2…im,pm)表示,
满足:
1<=i1<i2<…<im<=n;
且对于所有q(0<=q<k), s[i1][p1+q]=s[i2][p2+q]=…=s[im][pm+q]。

现在给定所有生物的DNA序列,请告诉科学家有多少的2m元组是需要关注的。如果两个2m元组有任何一个位置不同,则认为是不同的元组。

【输入格式】
输入的第一行包含三个整数n、m、k,两个整数之间用一个空格分隔,意义如题目所述。
接下来n行,每行一个字符串表示一种生物的DNA序列。
DNA序列从1至n编号,每个序列中的碱基从1开始依次编号,不同的生物的DNA序列长度可能不同。

【输出格式】
输出一个整数,表示关注的元组个数。
答案可能很大,你需要输出答案除以1000000007的余数。

【样例输入】
3 2 2
ATC
TCG
ACG

【样例输出】
2

再例如:
【样例输入】
4 3 3
AAA
AAAA
AAA
AAA

【样例输出】
7

【数据规模与约定】
对于20%的数据,k<=5,所有字符串总长L满足L <=100
对于30%的数据,L<=10000
对于60%的数据,L<=30000
对于100%的数据,n<=5,m<=5,1<=k<=L<=100000
保证所有DNA序列不为空且只会包含’A’ ’G’ ’C’ ’T’四种字母

资源约定:<

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