分享几种论文写作神器,提高你的写作效率

zotero-ocr:用于OCR的Zotero插件 佐泰罗OCR 这个Zotero插件增加了对在Zotero中选择的PDF执行OCR的功能。 它可以添加包括识别的文本,仅包含识别的文本的注释和HTML(HOCR)文件的新PDF。 Tesseract OCR用于文本识别本身。 先决条件 已安装Tesseract OCR 对于Windows,请参见 对于Linux和Mac,请参见 从poppler库下载并安装pdftoppm 安装 要安装扩展,请执行以下操作: 下载的XPI文件。 在Zotero中,转到工具→附加组件,然后将.xpi拖到附加组件窗口中。 可能在附加选项中调整Tesseract的路径。 配置 可以在“工具”→“ Zotero OCR首选项”下访问该配置: 此外,这些选项另存为Zotero首选项变量,也可以通过“”( 。 构建和发布 运行build.sh脚本,该脚本将创建一个新的.xpi文件。 对于新版本,请运行脚 立即下载

本人在写论文的时候,用到了很多工具,可用说这些工具可以大大提高写论文的效率,本文分享下我常用的论文神器。

(作者:黄海广)

本文介绍以下几种工具:

  • 论文管理神器Zotero

  • OCR神器(公式识别等)

  • Latex工具

  • 语法校对工具

  • 论文绘图工具

论文管理神器Zotero

一、Zotero简介

Zotero作为一款协助科研工作者收集、管理以及引用研究资源的免费软件,如今已被广泛使用。此篇使用说明主要分享引用研究资源功能,其中研究资源可以包括期刊、书籍等各类文献和网页、图片等。欢迎所有共同学习使用的朋友提供批评意见或补充使用经验。

下载地址:https://www.zotero.org/download/

ubuntu下安装zotero:

sudo apt-add-repository ppa:smathot/cogscinl 
# Say yes/press enter to accept any requests.
$ sudo apt-get update
# Wait for it to complete, then:
$ sudo apt-get install zotero-standalone

二、新建分类

步骤:我的文库→右键→新建分类→输入名称→鼠标右键我的文库→出现新建文件夹

三、英文文献信息导入

步骤(非常简单):

在新建目录下→鼠标拖入英文文献→右键重新抓取PDF文件的元数据→获取文献基本信息

备注:一些时间久远的英文论文也不能直接抓取数据,具体信息抓取方法参照第四部分中文文献的信息导入。

四、中文文献信息导入

步骤(稍复杂):

1. 在Text目录下→鼠标拖入中文文献

2. 在百度学术搜索文献→点击批量引用→导出到BibTex→下载

3. 用记事本打开下载好的.bib文件→复制全部内容

4. Zotero界面文件一栏→选择从剪贴板导入

5. 将PDF文件鼠标拖至刚导入文件成为其子文件→完成中文文献的信息抓取

五、插入文献

步骤:

1. Word中点击菜单栏中的“Zotero”工具栏→选择要引用的方式(默认选项没有的引用方式参见第六部分)

2. 鼠标光标置于要插入上角标处(即下图2处)→点击下图1处所示图标→2处出现红框内文字,3处出现Zotero快速格式化引文→点击快速格式化引文左边图标选择经典视图

3. 出现“添加/编辑引文”对话框→选择要引入的文献,点击OK

4. 下图1处出现上角标→光标置于参考文献3处→点击2处→3处引入参考文献成功

5. 其他文献可依次插入。Zotero有个特别强大的功能,如果中间一部分引文被删除,点击工具栏的Refresh,上角标以及参考文献会自动更新。

六、寻找非默认引文格式

步骤:

点击左上角Add/Edit
Citation工具→选择右下角管理样式→在 Zotero Style Repository对话框寻找想要的引文格式

七、使用坚果云同步文献

zotero只给了300m的空间,大概只能放80来篇文献的全文文件,如果文献较多就不能同步全文。注意:使用同步功能要先注册zotero账号。解决方法:使用坚果云:

坚果云官网:https://www.jianguoyun.com/

注意关闭手机验证,设置如图:

八、使用插件

Zotero还有不少插件,比较有名的是zotfile,Zotero DOl Manager,它们可以自动下载pdf,或者获取论文的DOI。

具体使用方法可以网上搜索获取。

OCR神器(公式识别等)

我发现了一个神奇的OCR工具:天若OCR,功能真的很好很强大。

免费版本可以识别图片文本,收费版本也不贵,59元一次性买个专业版,可以定义接口。

软件具有文本识别、翻译等功能,这些通用功能我就不展开说明了,我着重推荐两个功能:公式识别和表格识别。

公式识别

我之前推荐过公式的识别神器mathpix,真的很好用,但是免费的只有每个月50次,不够。

天若OCR可以设置mathpix的接口,mathpix接口一个月免费1000次识别,应该够了,注册的时候要绑定信用卡(注册过程要科学上网),识别效果:

原图片公式

识别后的公式,可以导出tex或者保存为word文件

表格识别

一般的OCR软件识别文字都问题不大,但是表格识别却是个问题,解决这个问题,这里推荐下腾讯优图的接口,目前每天200次识别免费。在天若OCR里配置好表格识别的接口为腾讯优图后,识别效果如下:


Period#Node#EdgeDiameter#WCCAPL
Over one week11653921183620011
Over two weeks9904407727373724
Over four weeks6900146461814334

原始表格图片

识别表格效果

识别后的表格,可以直接导入到word:

导入word效果

天若还可以对三线表添加网格后进行识别,非常方便。

在线的latex编辑和编译工具:overleaf

论文最终展现出来的就是一个PDF格式的文档。

当然可以使用word,但光排版这件事情,就能耗费你一半的精力。

正确的答案是,使用latex,它是一个专业的排版工具,按照latex的语法进行写作,执行编译就能够得到PDF文件。它的语法包含了如何排版,虽然相比word上手要慢,但在排版这件事情上,入门级别的latex语法,你要达到精通word的水平。

latex如何使用呢?当然,要安装编译器,再安装编辑器,本地一通配置,偶尔会遇到些问题,凭着强大的谷歌搜索,倒也不是什么难事。配置本地环境,不如直接使用在线编辑器。

www.overleaf.com

  • 注册即用,免去本地latex环境安装的痛苦。

  • 多人合作,共同编辑。

  • 富文本编辑模式,比写latex源码舒服些。

  • 随时可以完成在线编译,查看PDF。

按照overleaf的开始流程,有选择模板的过程,模板怎么选,还是要看投稿的期刊或者会议的要求。以KDD为例,在它的KDD 2019 Call for Research Papers页面上,给出了模板格式,看看能不能在overleaf上找到,即使没有,一会提供下载,自己上传到overleaf。

走过这一步,已经可以编译出模板PDF了,可以照猫画虎地写起来了。

grammarly:语法纠错神器

https://app.grammarly.com/

在这编辑文章的一句或一段话,语法出错了会有提示,低级的语法错误都能够避免。语法纠错

除了语法纠错之外,还有同意替换功能,我的塑料英语能想到的词汇都太过常见,不够精准(逼格不足),选中词就可以同义替换了。

同意替换

建议在word软件中安装grammarly插件,直接可用在word中进行语法校对和纠正。

论文绘图工具

本人在写机器学习相关论文的时候,很多图片是用matplotlib和seaborn画的,但是,我还有一个神器,Scikit-plot,通过这个神器,画出了更加高大上的机器学习图,本文对Scikit-plot做下简单介绍。

安装说明

安装Scikit-plot非常简单,直接用命令:

pip install scikit-plot

即可完成安装。

仓库地址:

https://github.com/reiinakano/scikit-plot

里面有使用说明和样例(py和ipynb格式)。

使用说明

简单举几个例子:

  • 比如画出分类评级指标的ROC曲线的完整代码:

from sklearn.datasets import load_digits
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sklearn.naive_bayes import GaussianNB
X, y = load_digits(return_X_y=True)
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.33)
nb = GaussianNB()
nb.fit(X_train, y_train)
predicted_probas = nb.predict_proba(X_test)
# The magic happens here
import matplotlib.pyplot as plt
import scikitplot as skplt
skplt.metrics.plot_roc(y_test, predicted_probas)
plt.show()

效果如图(相当高大上!)

图:ROC曲线

  • P-R曲线就是精确率precision vs 召回率recall 曲线,以recall作为横坐标轴,precision作为纵坐标轴。首先解释一下精确率和召回率。

import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.naive_bayes import GaussianNB
from sklearn.datasets import load_digits as load_data
import scikitplot as skplt
# Load dataset
X, y = load_data(return_X_y=True)
# Create classifier instance then fit
nb = GaussianNB()
nb.fit(X,y)
# Get predicted probabilities
y_probas = nb.predict_proba(X)
skplt.metrics.plot_precision_recall_curve(y, y_probas, cmap='nipy_spectral')
plt.show()

图:P-R曲线

  • 混淆矩阵是分类的重要评价标准,下面代码是用随机森林对鸢尾花数据集进行分类,分类结果画一个归一化的混淆矩阵。

from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier
from sklearn.datasets import load_digits as load_data
from sklearn.model_selection import cross_val_predict
import matplotlib.pyplot as plt
import scikitplot as skplt
X, y = load_data(return_X_y=True)
# Create an instance of the RandomForestClassifier
classifier = RandomForestClassifier()
# Perform predictions
predictions = cross_val_predict(classifier, X, y)
plot = skplt.metrics.plot_confusion_matrix(y, predictions, normalize=True)
plt.show()

图:归一化混淆矩阵

  • 其他图如学习曲线、特征重要性、聚类的肘点等等,都可以用几行代码搞定。

图:学习曲线、特征重要性

本章对Scikit-plot做下简单介绍,这是一个机器学习的画图神器,几行代码就能画出高大上的机器学习图,作者当年的博士论文也是靠这个画图的。仓库地址:

https://github.com/reiinakano/scikit-plot

里面有使用说明和样例。

参考

[1]:知乎:九老师

[2]:https://www.zotero.org

[3]:https://github.com/reiinakano/scikit-plot

总结

本文分享下我常用的论文工具,希望对读者写论文有所帮助,祝各位读者都能写出高大上的论文。

完)






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