为什么啊，有人知道吗

WXYHSH123

于 2024-03-28 20:03:07 发布

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文章标签： r语言

本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/WXYHSH123/article/details/137122692

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文章描述了在Rstudio中尝试使用GEOquery库从GEO数据库下载GSE14520数据集时，遇到`libcurl`下载失败的问题，导致`GSE14520-GPL3921_series_matrix.txt.gz`文件未能成功获取。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

在Rstudio中运行了如下代码，结果出现了下面的情况。

不知道为什么，第二行代码加上之前也是一样的情况

library(GEOquery)
options( 'download.file.method.GEOquery' = 'libcurl' )
if(!file.exists(f)){
  gset <- getGEO("GSE14520",destdir = ".",
                 AnnotGPL = F,
                 getGPL = F)
  save(gset,file = f)
}

> options( 'download.file.method.GEOquery' = 'libcurl' )
> if(!file.exists(f)){
+   gset <- getGEO("GSE14520",destdir = ".",
+                  AnnotGPL = F,
+                  getGPL = F)
+   save(gset,file = f)
+ }
Found 2 file(s)
GSE14520-GPL3921_series_matrix.txt.gz
Failure when receiving data from the peerFile stored at:
./GSE14520-GPL3921_series_matrix.txt.gz
Error in downloadFile(url, destfile = destfile, mode = "wb") : 
  Failed to download ./GSE14520-GPL3921_series_matrix.txt.gz!