PCA特征降维

特征降维是无监督学习的另一个应用,目的有两点:其一就是我们经常会在时间项目中面对特征维度非常高的训练样本,二往往又无法借助自己的领域知识人工构建有效特征;其二就是在数据表现方面,我们无法用肉眼观测超过三个维度的特征。因此降低维度不仅仅重构了有效的低维度特征向量,同时也为数据展现提供了可能。在特征降低维度的算法中,主成分分析是最为经典和实用的特征降低维度的方法,特别在辅助图像识别方面有突出的表现。
例子
import numpy as np;
import pandas as pd;

digits_train = pd.read_csv('https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/optdigits/optdigits.tra', header = None)
digits_test = pd.read_csv('https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/optdigits/optdigits.tes', header = None)

X_digits = digits_train[np.arange(64)]
y_digits = digits_train[64]

from sklearn.decomposition import PCA

estimator = PCA(n_components = 2)
X_pca = estimator.fit_transform(X_digits)

from matplotlib import pyplot as plt;

def plot_pca_scatter():
colors = ['black', 'blue', 'purple', 'yellow', 'white', 'red', 'lime', 'cyan', 'orange', 'gray']
for i in xrange(len(colors)):
px = X_pca[:, 0][y_digits.as_matrix() == i]
py = X_pca[:, 1][y_digits.as_matrix() == i]
plt.scatter(px, py, c = colors[i])

plt.legend(np.arange(0, 10).astype(str))
plt.xlabel('Fitrst Princlple Component')
plt.ylabel('Second Principle Component')
plt.show()

plot_pca_scatter()

实现PCA特征的基本方法和步骤可以分为以下几个关键环节: 1. **数据标准化**:由于不同特征的量纲可能不同,因此在进行PCA之前需要对数据进行标准化处理。这一步骤确保了每个特征在分析中具有同等的重要性。具体操作是将每个特征减去其均值,并除以其标准差。 2. **计算协方差矩阵**:通过标准化后的数据计算协方差矩阵,该矩阵反映了各特征之间的相关性。协方差矩阵的度等于原始数据的特征数量,矩阵中的每一个元素表示两个特征之间的协方差。 3. **计算协方差矩阵的特征值与特征向量**:特征值和特征向量是协方差矩阵的重要属性。特征值表示主成分的重要性,而特征向量则定义了主成分的方向。选择特征值较大的前k个特征向量作为主成分,以保留最多的信息。 4. **构造投影矩阵**:根据所选的特征向量构建投影矩阵。这个矩阵用于将原始数据转换到新的低空间中。 5. **数据转换**:利用投影矩阵将原始数据映射到由选定的主成分构成的新坐标系中,从而完成过程。 以下是一个使用Python实现PCA的示例代码: ```python from sklearn.decomposition import PCA from sklearn.preprocessing import StandardScaler import numpy as np # 假设X是输入数据集 X = np.array([[2.5, 2.4], [0.5, 0.7], [2.2, 2.9], [1.9, 2.2], [3.1, 3.0], [2.3, 2.7], [2, 1.6], [1, 1.1], [1.5, 1.6], [1.1, 0.9]]) # 数据标准化 X_std = StandardScaler().fit_transform(X) # 创建PCA实例并指定要保留的主成分数量 pca = PCA(n_components=2) # 这里假设我们想要保留两个主成分 # 拟合模型到数据上 pca.fit(X_std) # 转换数据到新空间 X_pca = pca.transform(X_std) ``` 在这个例子中,`StandardScaler`用来标准化数据,`PCA`类用于创建一个PCA模型,其中`n_components`参数指定了想要保留的主成分数量。最后,调用`transform`方法将数据转换到新的低空间。
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