R语言绘图基础篇:PCA分析与置信圈
PCA(Principal Component Analysis,主成分分析)是一种常用的数据降维技术,用于发现数据中的主要变化模式。在本文中,我们将介绍如何使用R语言进行PCA分析,并通过绘制置信圈来展示结果。
首先,我们需要加载所需的R包,并准备一个二维数据集用于演示:
# 加载所需的R包
library(ggplot2)
library(ggpubr)
# 创建一个二维数据集
set.seed(123)
data <- data.frame(x = rnorm(100), y = rnorm(100))
接下来,我们可以使用prcomp
函数进行PCA分析,并提取主成分的得分和贡献率:
# 进行PCA分析
pca <- prcomp(data)
# 提取主成分的得分和贡献率
scores <- as.data.frame(pca$x)
variance <- pca$sdev^2 / sum(pca$sdev^2)
现在,我们可以绘制PCA分析的结果。首先,我们可以使用散点图展示原始数据集及其主成分的得分: