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原创 Linux下Python文件的调用
Linux中,关于调用其他文件夹中的Python文件以及其中的类,可以采用获取获得本文件的绝对地址方式import syssys.path.append(os.path.dirname(os.path.dirname(os.path.realpath(__file__))))
2021-08-03 10:19:16
758
原创 torch_geometric和torch的版本匹配问题
安装torch_geometric 建议直接在网站下载安装。https://pytorch-geometric.com/whl/torch-1.7.0+cu101.html测试过几类网站,只有这个是正常
2021-01-30 13:41:49
3596
3
原创 2021-01-28
https://download.pytorch.org/whl/torch_stable.html下载torch和torchvision
2021-01-28 12:53:22
119
原创 堡垒机的使用
1,由于权限的问题不能直接在yuanyuan那个文件夹中上传文件,则先上传到hui文件中,再用sudo mv命令转移到指定文件夹下2,su -yuanyuandeng 使用已经搭建好的环境,在指定目录下运行相应的python
2020-08-26 22:10:25
489
原创 smiles构建分子图时出现ModuleNotFoundError: No module named ‘torch_sparse‘等错误
pip install torch-scatter==latest+${CUDA} -f https://pytorch-geometric.com/whl/torch-${TORCH}.htmlpip install torch-sparse==latest+${CUDA} -f https://pytorch-geometric.com/whl/torch-${TORCH}.htmlpip install torch-cluster==latest+${CUDA} -f https://pytor.
2020-08-05 20:13:17
1753
原创 pytorch中model.parameters()函数
model = ConvNet() #创建了一个实例optimizer = optim.Adam(model.parameters(), lr=learning_rate) #优化函数,model.parameters()为该实例中可优化的参数,lr为参数优化的选项(学习率等)for name, param in model.named_parameters(): #查看可优化的参数有...
2020-04-08 11:28:14
21559
转载 pytorch函数之nn.Linear
class torch.nn.Linear(in_features,out_features,bias = True )对传入数据应用线性变换:y = A x+ b参数:in_features - 每个输入样本的大小out_features - 每个输出样本的大小bias - 如果设置为False,则图层不会学习附加偏差。默认值:True代码:m = nn...
2020-04-07 21:05:06
776
原创 MNIST中的数据格式
trans = transforms.Compose([transforms.ToTensor(), transforms.Normalize((0.1307,), (0.3081,))])1.transforms.Normalize((0.1307,), (0.3081,))为:归一化操作,其中由于MNIST数据集为单通道图像,那么分别只有一个均值和一个标准差(一般的图像会有三个通道,...
2020-04-07 09:54:52
799
原创 CNN摘要
cnn中的滤波器实际上是用来降噪音增强特征的算法如右矩阵为增强该30所描绘出来的图像,某种意义来讲就是增强该种特征一层卷积中可以有多个卷积核,如下图提取人形特征那么第一层卷积就有四层输出,如下接下来,用第一层卷积的四层输出提取进一步的特征,如头,腿等主要也是在如下的两层输出中提取的那么过程为:(其中可知第二层卷积的卷积核为3维结构【下面第二张图】)...
2020-03-30 20:09:51
338
原创 添加__init__的含义
__init__方法,创建类的实例的时候,实例会自动调用这个方法,一般用来对实例的属性进行初使化。如:class Trainer(object): def __init__(self, model): self.model = modeltrain = Trainer(x)print(train.model)输出结果为x...
2020-03-17 20:12:18
478
原创 end-to-end representation learning using deep neural networks
输入原始数据,深度神经网络自己学习并输出预测结果
2020-03-17 17:12:14
273
原创 bean类数据顺序
后台的数据输出到前台,发现bean中的数据顺序有问题可以在bean中直接对数据顺序做处理@JsonProperty("ORG") privateStringORG; 紧接着 @JsonIgnore publicStringgetORG(){ returnORG; } @JsonIgno...
2019-08-12 19:27:11
243
原创 jupyter 导入csv文件
先将准备的文件上传到自己的jupyter工作空间import numpy as npimport pandas as pdhousing = pd.read_csv('housing.csv')
2019-07-10 09:27:45
18424
1
原创 sql语句
将一行中的某一列的值截取后,再与其他的字段组合更新到该行另外一列中:UPDATE drug_chemical_info SET originImgUrl= CONCAT("https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/image/imgsrv.fcgi?cid=",SUBSTRING(cIds, 5),"&t=l") SUBSTRING(cIds, 5)...
2019-07-08 15:39:39
301
原创 Vue基础理解
它们都有前缀$,以便与用户定义的属性区分开来。例如:var data = { a: 1 } var vm = new Vue({ el: '#example', data: data }) vm.$data === data // => true vm.$el === document.getElementById('example') // => ...
2019-07-04 11:33:07
189
原创 Vue基础理解
var obj = { foo: 'bar' } //这是创建一个对象Object.freeze(obj) //对该对象做函数限制new Vue({el: '#app',data: obj})//创建vue实例,data调用obj对象中的数据mvvm前台框架中可分隔为:html中的各种标签为V(视图)script中new出来的对象为VM(调度)一般data等类似...
2019-07-04 11:05:58
221
原创 R语言:导入文件的问题
直接读入excel 或者read.csv()函数导入后,再用synergyfinder中的ReshapeData()函数会出现非数字被强制转换成 ‘1’但在library(readr)包后,用read_csv()读入则不会出现上述情况...
2019-06-23 09:18:41
1765
原创 对生物信息工具的安装
先安装好BiocManager再具体安装其中的具体某个包,指令:BiocManager::install("synergyfinder")
2019-06-21 22:59:29
1024
转载 R语言中对各个文件的导入
R—读取数据(导入csv,txt,excel文件)导入CSV、TXT文件read.table函数:read.table函数以数据框的格式读入数据,所以适合读取混合模式的数据,但是要求每列的数据数据类型相同。read.table读取数据非常方便,通常只需要文件路径、URL或连接对象就可以了,也接受非常丰富的参数设置:file参数:这是必须的,可以是相对路径或者绝对路径(注意:Wind...
2019-06-21 14:33:49
6555
转载 C语言中,怎么用EOF结束输入
EOF 是个宏,其意思是:End Of File,文件尾标志。 从数值上来看,就是整数-1在C语言的头文件中对其进行了宏定义:1libio.h: # define EOF (-1)当读文件操作时,遇到文件结束位置或读数据出错均会返回 EOF。 (C语言中所有的输入输出操作均是按读文件的思想来设计的,或者说,是文件操作的一种特例,如getchar()就是fgetc(stdin) 的一个宏 )1...
2018-07-15 22:06:25
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4
转载 mysql prepare 预处理语句
PREPARE 预处理语句(转载)文章来自mysql参考手册MySQL 5.1对服务器一方的预制语句提供支持。如果您使用合适的客户端编程界面,则这种支持可以发挥在MySQL 4.1中实施的高效客户端/服务器二进制协议的优势。候选界面包括MySQL C API客户端库(用于C程序)、MySQL Connector/J(用于Java程序)和MySQL Connector/NET。例如,
2017-06-02 13:55:41
2941
转载 mysql常用语句
一、mysql常用语句创建,删除和最基本查询:显示数据库 mysql->show databases;创建数据库 mysql->create database db;删除数据库 mysql->drop database db;选择数据库 mysql->use db创建表 mysql->create table mytable(n
2017-06-01 15:24:18
347
mysql1241什么问题???
2018-03-07
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