学习fvcom生物模块遇到的问题之二

FVCOM生物模块运行错误解决记
在成功编译FVCOM后,尝试配置生物模块的初始和边界条件时遇到错误。通过研究mod_nctools.F中的UPDATE_VAR_BRACKET子程序,发现错误源于.nml文件中STARTUP_BIO_TYPE设置不当。将STARTUP_BIO_TYPE从'observed'改为'constant'后,模型正常运行。重视阅读手册和源代码对于理解FVCOM至关重要。

在fvcom编译成功了以后,跟据手册所说,需要加入生物的初始条件和边界条件。在bio_model.in这个生物参数文件中,我构建了一个最简单的npzd模型,并使初始值为常数。然后给河流边界中加入各个生物变量的变化值。整理好之后,准备run模型。


在终端中打印出了biological model的参数设置。然后就出错了,给的提示让我一开始摸不着头脑,后来我通过检索关键字:UPDATE_VAR_BRACKET,在mod_nctools.F中找到了这个子程序。


同时在这个subroutine中找到了与错误相关的信息:

知道了错误的出处之后,回头再想,为什么在这里就停了,刚好在打印了biological model的参数信息之后,是在哪个文件中调用了这个subroutine,并打印了这些信息呢?

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