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原创 【ArcGIS】绘制样品分布图
根据之前将excel导入ArcGIS,生成shp文件的基础上,绘制样品分布图。还可以在【高级】处,根据大小等设置图形的大小,根据自己表格中的字段选择即可。3. 显示选择类别-唯一值(值字段选择要分类的内容即可)4.点击添加至所有值,可以看到该类别的内容。1. 右击对应表格/图层,选择属性。
2024-10-16 19:52:22
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原创 DAVID进行基因富集分析
Step2.选择上传基因的格式【这里上传的为symbol】,Step2a填写对应物种【本文以鸿雁为例】结果查看,点击GO,我主要关注GO的BP, CC和MF三个组分。Step3.选择上传列表的格式,在Step4.点击上传列表。(DAVID首页长这样,网站上也有对应的操作指引)#点击Upload,在Step1.方框处上传基因集。#候选基因进行GO和KEGG富集分析。点击Chart可以查看和下载结果。
2024-10-14 20:04:51
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原创 【rJava】java.lang.0utofMemoryError:Java heap space
运行R时,由于数据量较大,导致rJava运行内存不足。运行时可以看到R占用内存已经达到127.1G了。在加载所有包之前,先设置好rJava的堆内存。解决方法,重新启动R。
2024-09-06 10:54:30
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原创 【ArcGIS】对齐栅格和设置行列一致
bio1_china文件之前是用shi_wgs1984该文件裁剪过,新生成的water_re同样裁剪和设置环境,环境设置与上一步一致。2. 数据管理工具-栅格-栅格处理-重采样-输入需要修改的栅格,输出大小-再选择环境-按需求设置处理范围以及捕捉栅格-确定。查看新生成的water_remas,可以看到行列以及范围均与bio1_china一致。1. 右击图层,查看图层属性,可以看到两个栅格文件的行列数以及范围均不相同。此时新生成的water_re的行列数已改变,但仍未与bio1_china相同。
2024-08-31 20:11:26
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原创 【ArcGIS】Excel数据导入ArcGIS并转为栅格
3.右击表格,选择“显示XY数据”,指定X字段为经度,Y字段为纬度。点击“确定”后会弹出提示,再次“确定”,并根据提示将表格转为shp格式。本文目标:将excel表中的数据导入ArcGSI,并根据经纬度将指定要素转为栅格文件(本文根据经纬度将“最大值”这一要素转为栅格文件)。右击表格-数据-导出数据-确定,注意看输出要素类是否为shp。输入完要素后,选择 环境-处理范围-(这里绘制中国地图,因此选择与中国区县地图范围的shp数据)-确定。输入对应点要素和Z值要素(这里以excel表中“最大值”为例)。
2024-08-29 11:59:49
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原创 【ArcGIS】栅格计算器
3.在栅格计算器中进行计算,此处为计算“nsun1981”和“nsun1982”两个栅格文件的平均值,输出文件同样为栅格文件,导出即可。1. 在工具栏处点击“搜索框”;或“Ctrl+F”调出搜索框。本文目标:利用栅格计算器计算多个栅格文件的平均值。2.搜索“栅格计算器”即可调用。
2024-08-29 10:29:31
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空空如也
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