PEPTIDE LIBRARY 多肽文库构建和筛选

本文详细介绍了多肽文库的概念、类型及其在生物学和化学研究中的应用,包括首尾相搭多肽矩阵、截头多肽矩阵、Ala筛选矩阵、随机多肽文库和Scrambled Peptide Library。此外,还提到了多肽文库的服务内容,如基于已知结构的定制肽库、噬菌体展示肽库、一株一物化学组合多肽库和DNA编码的化学组合多肽库,用于筛选具有特定生物活性的多肽。

1、肽库构建与筛选

肽库概念:

肽库,是大量特定长度且序列不同的小肽的集合,它包括了该长度短肽中各种(或绝大部分)氨基酸序列的排列组合。有些多肽虽然其序列与抗原的天然表位不同,但在结合抗体或配体时的方式是相同的,因此这种具有关键氨基酸残基的多肽称为模拟表位(mimotope)。模拟表位的概念在肽库发展过程中起到了重要的推动作用。肽库能够为药物设计,蛋白质-蛋白质相互作用以及其他生化和药物研究和应用提供强大的工具。

生物学和化学研究中,多肽文库是一种强大的筛选工具。它用于从大批量多肽中筛选极少量具关键生物活性的多肽。多肽文库在蛋白质组学及其相关领域应用范围非常广泛,如药物研发、蛋白-蛋白相互作用、抗原表位筛选、GPCR配体筛选、蛋白功能分析、酶底物或抑制剂筛选、信使分子研发及多肽/蛋白信号对答等。

 

2、多肽文库类型

 

首尾相搭多肽矩阵(Overlapping Peptide Library): 主要用于全蛋白扫描。蛋白从N端开始,逐步向C端截取设计后,最后很有可能会剩下一条孤肽(Orphan peptide),我们建议一般是将N端转移一个或者几个氨基酸过来,以保持一致长度。

截头多肽矩阵(Truncation Peptide Library): 用于确定表位的最小范围。截头多肽矩阵的建立方法一般是系统性地去除原多肽序列两侧氨基酸而得到的。头多肽矩阵用于鉴定与活性有关的最少氨基酸序列。

Ala筛选矩阵(Alanine Peptide Scanning Library):

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