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原创 SPM学习笔记:坐标展示和被试水平的一阶处理

units of design:onset的单位onset:每一个run根据task把内容复制黏贴进去multiple conditions:时间戳,代表不同时间条件regressor:回归因子multiple regressors:和实验条件无关的回归因子,比如头动的参数。

2025-06-14 15:17:59 637

原创 静息态功能磁共振成像(rs-fMRI)原理与数据分析学习笔记(9-10):DPARSF Output and Reproducibility

Sub里mean开头的是做完realign后的平均像,包括结构像配到功能空间,reslice等。T1Raw→T1Img→T1ImgCoreg→T1ImgNewSegment(做分割)wmean:配到mri空间的像,可以用于看配准配得好不好。Template_X:Dantell生成的模板。FD作为协变量:每个时间点的头动信息。rp开头的文件里面是xyz信息。每个结构都有自己的mats。

2025-06-14 14:39:53 291

原创 SPM学习笔记:统计方法选择、计算、结果分析

一般使用的是two-sample(control vs cases,cases1 vs cases2)和ANOVA。estimate选择之前保存的mat数据后运行,生成beta值文件 ,即每一个condition下的系数。contrast:组间区别,需要定义,如正常组定义为最小值,异常组为最大值(也可以反过来,看需求)。把SPM.mat的文件导进去 去做一个统计分析的矩阵,可以选T检验或者F检验。采用一般线性模型去做一个估计,来得到每一个体素的激活情况。结果使用Results显示。

2025-06-11 23:06:00 600

原创 SPM学习笔记:预处理

讲解了使用SPM12进行fMRI数据预处理的完整流程。

2025-06-11 13:26:56 975

原创 SPM学习笔记:将DICOM格式转为NII格式文件

安装MATLAB后将SPM文件夹拖入/toolbox文件夹中,然后在MATLAB界面的“设置路径”中选择刚刚放进去的SPM文件夹,保存设置。先点击DICOM import,会弹出batch editor的窗口。转换完了会弹出提示。应该有批量转换的办法,但是目前还没有整理出来……双击DICOM files,弹出窗口导入需要转换的DICOM文件。双击output directory,选择输出的文件夹。需要版本对应,如MATLAB2023b对应SPM12。在命令行中输入“spm”,弹出界面就是安装成功。

2025-06-10 23:54:00 378

原创 静息态功能磁共振成像(rs-fMRI)原理与数据分析学习笔记(8):Statistical Analysis

fMRI数据通常包含成千上万个体素(voxels),在每个体素上进行统计检验会导致大量的多重比较,增加假阳性率(Type I error)。传统的参数检验方法(如t检验)依赖于正态分布等假设,而这些假设在实际数据中不一定满足。置换检验通过数据本身的重排来直接估计检验统计量的零分布,从而更准确地控制错误发现率(如FWE,家族错误率)。传统参数方法假设数据服从特定的分布(如正态分布),而fMRI数据通常偏离这些假设。置换检验是一种非参数方法,不依赖于数据的分布假设,具有更好的鲁棒性。

2025-06-06 13:32:01 318

原创 静息态功能磁共振成像(rs-fMRI)原理与数据分析学习笔记(7):Dynamic Analysis

指的是大脑活动信号随时间的变化特征和模式。

2025-06-05 22:18:28 604

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