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原创 突破传统机器学习单模型性能瓶颈:高维蛋白质组学数据的集成机器学习策略

在10X-蛋白质组学时代,数据不再是多,而是“多且异”。具体方法包括基于统计差异的初步筛选、非线性关系挖掘,以及递归特征消除(RFE)、LASSO回归、随机森林等复杂算法,以实现维度降低、模型效率提升及可解释性增强。提供详尽的报告,包括模型决策路径分析、关键特征(生物标志物)重要性排序、以及丰富的可视化图表(如ROC曲线、特征重要性图等),将数据结果转化为清晰的生物学语言。(包括RF、XGBoost、GLMNET、SVM、NNET等机器学习算法模型)、。(包括:蛋白、磷酸化、代谢、转录等组学数据)、

2026-01-06 13:11:25 315

原创 网络药理学联合蛋白修饰组学研究新范式 | 药物-靶点-修饰-疾病,一网打尽!

景杰生物依托多组学整合+AI分析技术,可以为研究人员提供。等,推动客户的药物研究进入系统化、智能化的新阶段。的全流程网络药理学生信分析服务,包括。

2026-01-05 09:25:35 221

原创 空间蛋白质组研究必看!手把手教你ROI选区思路

肿瘤组织内的细胞异质性和可塑性是肿瘤进展和肿瘤免疫微环境调节的基础,但其状态转化和调控机制尚不明确。因此,研究首先整合单细胞RNA测序、空间转录组学分析了宫颈鳞癌肿瘤组织的免疫空间特性,系统描绘宫颈鳞癌的免疫空间图谱,并确定了。,首次在无先验组织学信息下揭示了肿瘤边界、血管微环境及免疫细胞浸润区域的功能异质性,证实LCM驱动的空间蛋白质组学可系统解析肿瘤分子特征并指导精准治疗。作为生命科学研究的革命性技术,极大地推动和颠覆了精准医学的研究模式,在理解细胞功能、信号转导及疾病机制展现了令人振奋的潜在前景。

2026-01-04 13:44:25 520

原创 生命之海的精准导航仪:Blood 600,开启靶向研究新纪元

然而,传统的血液靶向研究存在“碎片化”问题:以往针对单类疾病(如心脑血管或神经系统)设计的小规模检测方案,虽在特定方向有效,却。靶向的600个蛋白质中超70%的蛋白是低丰度蛋白,这些分子以往难以稳定检测,却极具生物标志物潜力。在样本制备环节进行严格把控,所有分析样本中,血小板来源蛋白占比均低于3%,检测数据真实可靠。血液如同身体的“信息库”,其中的蛋白质变化能直接反映我们的健康状况。等,完成了数以千计的样本检测,积累了丰富的技术开发和项目经验。,实现ng/L级超高灵敏度的靶向定量和验证。

2025-12-30 18:54:42 457

原创 【CUT&Tag分析工具上新第二弹】Peak注释+功能富集

通过CUT&Tag注释图可展示目标蛋白基因结合区域分布,而CUT&Tag富集分析工具则可通过对这些结合位点注释到的基因进行GO(Gene Ontology)和KEGG pathway功能富集分析,揭示蛋白质结合位点所调控的关键生物学功能、信号通路及疾病关联。CUT&Tag可精确鉴定蛋白质(如转录因子、组蛋白修饰)在基因组上的结合位点(Peak),而结合在基因不同区域的目标蛋白,会通过不同的作用机制调控基因表达,Peak的功能性区域注释有助于我们比较不同目标蛋白的调控机制。”(上次推文链接)进行图形优化。

2025-12-29 13:31:19 770

原创 基于质谱的MHC检测:肿瘤新抗原鉴定与药物研发的革新力量

例如,某些肿瘤新抗原肽段与特定的MHC 分子结合后,会在肿瘤细胞表面形成独特的抗原表位,基于质谱检测发现这些抗原表位后,可设计特异性抗体与之结合,阻断肿瘤细胞的信号传导通路,或通过抗体依赖的细胞介导的细胞毒性作用(ADCC)和补体依赖的细胞毒性作用(CDC)清除肿瘤细胞。,质谱仪通过测量肽段的质荷比(m/z),并对肽段进行碎裂,得到其碎片离子的质荷比信息,再结合(突变的基因数据库)数据库搜索和生物信息学分析,确定肽段的氨基酸序列,从而鉴定出与MHC结合的高潜力肿瘤新抗原肽段。将显著提升数据分析能力。

2025-12-26 15:54:31 894

原创 尿液蛋白质组学:开启无创疾病诊断的“新钥匙”

基于自主研发的富集材料,结合先进的10X蛋白质组学,对尿液蛋白质组学的前处理平台和质谱平台进行技术革新,大大提高了尿液样本蛋白质组学分析的鉴定灵敏度、检测深度、定量准确性,实现。景杰生物作为蛋白质组学驱动精准医学领域的领军企业,率先开发并推出全新高深度10X Proteomics技术,实现常规蛋白质组的高深度覆盖,并进一步将。等优势,快速全面地获得尿液蛋白质的动态变化,为发现新的生物标志物和分型提供新的理解。,利用自动化机器人替代人工处理,专用尿液蛋白质组学研究,提升样本检测的效率和平行性,

2025-12-25 08:54:40 645

原创 景杰云平台CUT&Tag分析工具首发:助力表观遗传研究的利器

通过信号峰出现的位置,可以判断序列主要富集在基因的TSS(转录起始位点)、genebody或者TES(转录终止位点)附近,从而揭示目的蛋白与基因表达调控之间的关系。看到这里,如果您对景杰云平台的CUT&Tag分析工具感兴趣,欢迎注册景杰生信云平台(https://www.ptm-biolab-css.com.cn/cloud/cloudTool),在这里,您将享受到。,在热图顶部同时增加曲线图,让您的图片类型更加丰富多样,满足不同期刊的投稿要求。,随心所欲修改热图中的颜色,让您的热图更具吸引力。

2025-12-24 09:30:28 746

原创 景杰生物 | 从基础研究到临床转化,蛋白质组学深度赋能ADC药物研发创新

未来,随着单细胞蛋白质组学、空间蛋白质组学等前沿技术的兴起,以及人工智能驱动的数据分析方法的融合,基于质谱的蛋白质组学将进一步推动ADC药物从基础研究到临床转化的全链条创新,为精准肿瘤治疗开辟新的可能性。总的来说,ADC药物的研发痛点在于涉及多个环节的优化和验证,包括抗体的选择、连接子的设计、细胞毒性药物的筛选、药物的体外和体内评价等。例如,利用基于质谱的热蛋白质组学技术,鉴定药物的直接靶蛋白,了解药物与蛋白质的相互作用,以及研究蛋白质的功能和细胞内调控网络。,如微管抑制剂、DNA损伤剂等。

2025-12-23 08:58:59 682

原创 景杰生物CUT&Tag技术进阶,临床样本应用 “尽在掌握”

例如,若某转录因子在某种神经退行性疾病中过度激活,通过生信分析找到可抑制其活性且对机体其他正常生理功能影响小的小分子药物靶点,为开发新型靶向药物奠定基础,加速从基础研究到临床治疗的转化进程。本案例发现,两组样本中,:临床样本研究可以直接观察药物在人体中的疗效和不良反应,为药物研发和临床治疗方案的制定提供最直接的依据。若结合基因富集于肿瘤通路基因,提示目的蛋白/修饰在肿瘤进程中有重要作用,助于研究发病机制。虽然临床样本研究的好处众多,但是对于CUT&Tag应用来说,临床样本存在一定风险,因为。

2025-12-22 13:21:12 254

原创 多肽组学:解码生命活动的“隐形信使”

无论是疾病标志物筛选、功能肽挖掘,还是多肽药物开发,景杰生物以“高灵敏度、高深度、高准确度”的技术承诺,为科研与临床提供最强助力!以往的多肽组学分析存在多肽难富集、鉴定深度低、难以验证等问题,严重制约了多肽的深入研究。在传统多肽搜库策略中,由于多肽组N-/C-端的氨基酸无规律,搜库检索空间大,搜库极慢,错误鉴定概率高。多肽可以间接地反映出生物机体的蛋白质异常代谢情况,早在2000年,科学家提出多肽组学的概念。2)多肽药物开发从实验室到临床,全球已上市的多肽药物超百种,涵盖糖尿病、抗癌等领域。

2025-12-19 13:11:06 273

原创 解锁植物微观奥秘:景杰生物首发植物单细胞蛋白质组学技术

为植物生物学和作物改良提供重要信息。在该研究中,作者重点关注拟南芥根部的皮层和内皮层两种相邻细胞类型,这两种细胞类型源自共同的干细胞系,但在功能上有所不同。单细胞层面的蛋白质组学分析为植物研究提供了精准信息,能够深入探究植物细胞异质性,构建精细蛋白分子图谱,并分析细胞间的空间蛋白质网络,在构建不同细胞类型的细胞蛋白表达图谱或鉴定不同细胞类型的功能研究中经常需要对复杂样本的多种细胞进行大规模分析。,为植物细胞异质性研究、精细蛋白分子图谱构建等提供最本质的精准信息,助力深入探索植物单细胞的生物学机制!

2025-12-18 09:02:21 584

原创 景杰生物第五届生信研修班圆满落幕!引领技术协同创新,推动精准医学产业化进程

等生信分析与精准医学领域专家,现场分享最新科研成果,搭建前沿交流桥梁。景杰生物生信团队结合实战经验,为与会师生拆解AI赋能蛋白组学与生信分析的进展及技术细节,帮助学员将理论转化为可落地实施的科研技能。,专家与讲师结合自身经验细致解答,现场氛围热烈且务实。同时,研修班特别设置“面对面答疑opencourse”,技术专家一对一对投稿困惑、课程疑点、科研难点逐一解答,真正实现“带着问题来,揣着答案走”。本次活动的举办,既是推动行业技术普及与科研协作的重要举措,也是开放自身技术经验、助力科研工作者成长的责任体现。

2025-12-16 13:32:28 186

原创 景杰生物智慧实验室荣膺CNAS认可,铸就客户信赖新标杆

同时积极探索和应用智能化技术,实现了管理的自动化、信息化和智能化,为客户带来了更高的效率和更好的体验。景杰生物作为全球蛋白质组学及翻译后修饰组学的领跑者,一直以来致力于以创新技术推动科学研究的进步与发展。通过持续的质量监控和改进措施,为科研人员提供可靠的实验数据支持。”的宗旨,以更高水平的质量管理和技术创新,为全球合作伙伴提供更具国际公信力、更值得信赖的研发支持与检测分析服务,共同推动生命科学领域的高质量发展,推动精准医学的进步。这不仅是对景杰生物现有实力的肯定,更是对客户价值的提升,代表着。

2025-12-15 13:58:55 358

原创 景杰生物智慧实验室再添利器,第五台Astral仪器赋能科研新征程

Astral质谱仪作为全球领先的高分辨质谱仪,以其卓越的性能和创新的技术,为蛋白质组学研究带来了前所未有的突破。新仪器的引入,也将进一步支撑景杰生物创新修饰组学、空间蛋白质组学、单细胞蛋白质组学等前沿技术的开发与应用,为蛋白质组学技术进步与产业发展贡献更多力量。,一直致力于推动生命科学研究和生物技术的发展。此次引进第五台Astral仪器,是公司战略布局的重要一步,也是对技术创新和高质量服务的不懈追求。,将为客户项目提供高质量产能保障,也为景杰智慧实验室的建设增添了浓墨重彩的一笔。,对组学数据深度挖掘,

2025-12-12 17:10:31 309

原创 【STTT | 华西医院杨家印等团队揭示琥珀酰化调控肝癌放疗抵抗新机制】

值得注意的是,由RAD52外显子10编码的肽段包含RAD51结合结构域,该结构域通过介导RAD52-RAD51复合物形成来促进HR,由此可见,SRSF11对HR和放疗抵抗的促进作用依赖于其对RAD52外显子10可变剪接的调控。为理解琥珀酰化修饰在DNA损伤修复中的功能提供了新视角,同时将SRSF11的K419琥珀酰化确立为肝癌放疗抵抗的潜在干预靶点,为开发针对该信号轴的抑制剂以改善肝癌放疗效果的临床转化研究奠定了基础。作为新型酰化研究的领跑者,在上万例样品中积累了丰富的新型酰化修饰研究经验和实验方案。

2025-12-11 15:09:36 899

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