揭秘Moran‘s I与Geary‘s C:如何用R构建精准空间自相关模型

第一章:揭秘Moran's I与Geary's C:空间自相关的理论基石

在空间数据分析中,理解地理现象之间的相互依赖性是核心任务之一。Moran's I 与 Geary's C 是衡量空间自相关性的两个经典统计指标,它们揭示了地理位置相近的观测值是否在数值上也趋于相似。

Moran's I:全局空间聚集性的度量

Moran's I 通过计算每个位置与其邻居的属性值协方差来评估整体空间模式。其值通常介于 -1 到 +1 之间:
  • 接近 +1 表示强正空间自相关(相似值聚集)
  • 接近 0 表示随机分布
  • 接近 -1 表示负空间自相关(相异值相邻)
公式定义如下:

I = (n / S₀) * ΣᵢΣⱼ wᵢⱼ (xᵢ - x̄) (xⱼ - x̄) / Σᵢ (xᵢ - x̄)²
其中,n 为样本数,wᵢⱼ 是空间权重矩阵元素,S₀ 是所有权重之和, 为均值。

Geary's C:基于差异的空间不均衡检测

Geary's C 更关注相邻区域间的数值差异,其表达式为:

C = [(n - 1) / (2 S₀)] * ΣᵢΣⱼ wᵢⱼ (xᵢ - xⱼ)² / Σᵢ (xᵢ - x̄)²
与 Moran's I 不同,Geary's C 对局部变化更敏感:
  • C ≈ 1 表示无空间自相关
  • C < 1 表示正相关
  • C > 1 表示负相关

指标对比与适用场景

特性Moran's IGeary's C
基础逻辑协方差差值平方
范围[-1, +1][0, 2]
对全局模式敏感度中等
对局部突变响应较弱较强
graph TD A[空间数据] --> B{选择指标} B -->|检测聚集趋势| C[Moran's I] B -->|检测局部差异| D[Geary's C] C --> E[解释全局模式] D --> F[识别异常边界]

第二章:R语言空间数据分析环境搭建

2.1 理解空间权重矩阵:从邻接关系到空间滞后

在空间计量分析中,空间权重矩阵是刻画地理单元之间相互关系的核心工具。它量化了“邻近”概念,为后续的空间自相关检验与空间滞后模型构建奠定基础。
空间权重的构建方式
常见的空间权重包括二进制邻接矩阵和距离衰减权重。例如,基于Rook邻接关系的权重矩阵可表示如下:

import numpy as np
W_rook = np.array([
    [0, 1, 0],
    [1, 0, 1],
    [0, 1, 0]
])
该矩阵表明区域1与区域2相邻,区域2与1、3相邻,而区域1与3无直接邻接。值为1表示邻接,0表示不相邻,对角线恒为0以排除自关联。
空间滞后的数学表达
空间滞后变量定义为:\( y_{\text{lag}} = W y \),即各区域的加权平均邻域值。该操作揭示了“邻居的影响力”,是空间依赖建模的关键步骤。

2.2 安装并配置spdep、sf等核心R包实现空间数据读取

在进行空间数据分析前,需安装支持空间对象处理的核心R包。使用以下命令安装必要依赖:
install.packages(c("sp", "sf", "spdep", "rgdal"))
该命令批量安装`sp`(基础空间结构)、`sf`(简单要素支持)、`spdep`(空间依赖建模)和`rgdal`(地理数据抽象库接口)。其中,`sf`包采用ISO标准的简单要素模型,已成为R中空间数据的新标准格式。 加载后可通过`st_read()`函数读取Shapefile或GeoJSON文件:
library(sf)
data <- st_read("path/to/your/spatial_data.shp")
此函数自动解析几何与属性信息,返回`sf`类对象,便于后续空间操作与可视化集成。

2.3 构建空间邻接结构:基于距离与邻接的权重定义

在空间数据分析中,构建合理的空间邻接结构是揭示地理单元间相互关系的关键步骤。邻接权重矩阵用于量化区域之间的空间依赖性,其定义方式直接影响后续的空间自相关分析与建模效果。
基于邻接关系的权重构造
最常见的方式是采用二进制邻接矩阵(Rook或Queen准则),即若两个区域共享边界或顶点,则赋值为1,否则为0。该方法逻辑清晰,适用于行政区划等离散空间结构。
基于距离的空间权重
更精细的方法引入地理距离,如反距离权重:
import numpy as np
def inverse_distance_weight(coords):
    n = len(coords)
    W = np.zeros((n, n))
    for i in range(n):
        for j in range(n):
            if i != j:
                dist = np.linalg.norm(coords[i] - coords[j])
                W[i][j] = 1 / dist
    return W
此函数计算各点间的欧氏距离倒数作为权重,距离越近影响越大。参数 coords 为坐标数组,输出矩阵 W 可进一步行标准化处理以消除规模偏差。
权重矩阵的标准化
通常对原始权重矩阵进行行标准化,使每行权重之和为1,提升模型稳定性。

2.4 数据预处理:空间对象转换与缺失值的空间影响控制

在地理信息系统与空间数据分析中,原始数据常存在坐标系不统一与空间缺失问题。为确保分析精度,需对空间对象进行标准化转换。
坐标系标准化
将不同来源的空间数据统一至同一投影坐标系(如WGS84转UTM)是关键步骤。常见操作如下:

import geopandas as gpd
# 读取Shapefile并转换坐标系
gdf = gpd.read_file("data.shp")
gdf_utm = gdf.to_crs("EPSG:32633")  # 转换为UTM Zone 33N
该代码将地理坐标(经纬度)转换为平面投影坐标,提升距离与面积计算的准确性。
缺失值的空间插值补偿
空间自相关性要求缺失值不能简单忽略。采用反距离权重法(IDW)可有效控制其影响:
  • 识别具有空间缺失的区域
  • 基于邻近观测点的距离加权估算缺失值
  • 验证插值结果的空间连续性

2.5 可视化初步:使用ggplot2与tmap展示空间分布模式

基础空间绘图工具介绍
在R语言中,ggplot2 提供了强大的分层绘图系统,而 tmap 则专注于地图可视化。两者均支持空间数据的直观表达,适用于探索地理变量的分布模式。
使用ggplot2绘制空间点分布

library(ggplot2)
ggplot(data = cities) +
  geom_point(aes(x = lon, y = lat, color = population), 
             size = 2, alpha = 0.7) +
  scale_color_viridis_c(option = "B") +
  theme_minimal() +
  labs(title = "城市人口空间分布", x = "经度", y = "纬度")
该代码通过aes()映射经纬度与人口颜色,alpha增强重叠点可读性,viridis调色板提升视觉对比。
利用tmap呈现区域地理信息
  • tmap_mode("view")启用交互模式
  • tm_shape()加载空间对象
  • tm_polygons()渲染区域填充

第三章:Moran's I统计量的理论解析与R实现

3.1 Moran's I数学原理与显著性检验方法

空间自相关的量化指标
Moran's I 是衡量空间数据自相关性的核心统计量,其公式定义如下:

I = (n / S₀) * ΣᵢΣⱼ wᵢⱼ (xᵢ - x̄) (xⱼ - x̄) / Σᵢ (xᵢ - x̄)²
其中,n 为样本数量,wᵢⱼ 为空间权重矩阵元素,S₀ = ΣᵢΣⱼ wᵢⱼ 为权重总和, 为变量均值。该指标反映邻近区域属性值的相似程度。
显著性检验流程
为判断 Moran's I 是否显著,需进行假设检验:
  • 原假设 H₀:空间要素呈随机分布(无空间自相关)
  • 备择假设 H₁:存在显著的空间聚集或离散
通过计算 z 得分:z = (I - E[I]) / √Var(I),并与标准正态分布比较,若 |z| > 1.96,则在 α=0.05 水平下拒绝原假设。
结果解释与应用
Moran's I 值空间模式
接近 1强正相关(聚类)
接近 -1强负相关(离散)
接近 0随机分布

3.2 利用spdep包计算全局Moran's I并解读结果

在空间统计分析中,全局Moran's I用于衡量空间自相关性。R语言中的`spdep`包提供了完整的工具链来构建空间权重矩阵并计算该指标。
构建空间邻接关系
首先基于地理单元的邻接关系生成空间权重矩阵:

library(spdep)
nb <- poly2nb(geodata)  # 构建邻接列表
listw <- nb2listw(nb, style = "W")  # 标准化为行标准化权重
其中`poly2nb`识别相邻多边形,`nb2listw`转换为可用于空间自相关的权重对象,`style = "W"`表示行标准化。
计算与解读Moran's I
调用`moran.test`进行检验:

moran.test(geodata$value, listw)
输出包含Moran's I值、期望值、方差、z值和p值。I > E(I)且显著(p < 0.05)表明存在正向空间聚集,即相似值倾向于空间聚集分布。

3.3 局部Moran's I(LISA)分析与热点图绘制

局部空间自相关识别
局部Moran's I(Local Indicators of Spatial Association, LISA)用于探测空间数据中的局部聚集模式,识别高-高(热点)、低-低(冷点)、高-低和低-高四种聚类类型。
Python实现示例
from pysal.explore import esda
from pysal.lib import weights
import geopandas as gpd

# 构建空间权重矩阵
w = weights.Queen.from_dataframe(gdf)
w.transform = 'r'

# 计算局部Moran's I
li = esda.moran.Moran_Local(gdf['value'], w)
上述代码首先基于邻接关系构建Queen权重矩阵,并进行行标准化('r'),随后对目标变量计算局部Moran's I值,输出每个区域的聚类类型及显著性。
聚类类型对照表
聚类类型含义
HH高值被高值包围(热点)
LL低值被低值包围(冷点)
LH低值被高值包围
HL高值被低值包围

第四章:Geary's C与Moran's I的对比建模实践

4.1 Geary's C的统计特性及其与Moran's I的异同

Geary's C 是一种用于检测空间自相关的统计量,其值通常介于0到2之间。越接近0表示强正相关,接近2则为负相关,1表示无空间自相关。
与 Moran's I 的核心差异
  • Geary's C 对局部差异更敏感,基于相邻区域属性值的差值平方;
  • Moran's I 则基于协方差机制,反映整体趋势;
  • 两者虽均衡量空间聚集性,但 Geary's C 更强调邻接单元间的不连续性。
统计公式对比

Geary's C = ( (n-1)/2W ) * Σ_i Σ_j w_ij (x_i - x_j)² / Σ_i (x_i - x̄)²
Moran's I = (n/W) * Σ_i Σ_j w_ij (x_i - x̄)(x_j - x̄) / Σ_i (x_i - x̄)²
其中,n 为区域数量,W 为权重矩阵总和,w_ij 表示空间权重, 为均值。可见二者分子结构不同,导致对空间模式响应存在差异。

4.2 在R中实现Geary's C计算并与Moran's I对比

在空间自相关分析中,Geary's C与Moran's I是两个核心指标。前者对局部差异更敏感,后者更关注整体趋势。
计算Geary's C的R实现

library(spdep)
data("nc.sids")
nb <- poly2nb(nc.sids)
lw <- nb2listw(nb, style = "W")
geary_c <- geary.test(nc.sids$SID74, lw)
print(geary_c)
该代码段首先构建邻接关系(poly2nb),转换为列表权重(nb2listw),最后调用geary.test计算统计量。输出包含C值、期望值和显著性检验结果。
与Moran's I的对比分析
指标取值范围敏感性期望值
Moran's I≈[-1,1]全局趋势E(I) ≈ -1/(n-1)
Geary's C[0,2]局部差异E(C) = 1
当C < 1时表明存在正自相关,与Moran's I趋势一致,但Geary's C对相邻区域间的微小波动响应更强。

4.3 模拟空间随机场验证两种指标的敏感性差异

在复杂系统建模中,空间随机场常用于表征区域化变量的空间异质性。为评估不同敏感性指标对输入场变异的响应差异,构建高斯随机场作为输入源,并对比方差分解法(Sobol指数)与局部梯度法(Morris筛选)的表现。
模拟流程设计
  • 生成具有指定协方差结构的二维随机场
  • 分别计算 Sobol 指数与 Morris 要素敏感度
  • 比较二者在边缘分布变化下的响应灵敏度
import numpy as np
from sklearn.gaussian_process import GaussianProcessRegressor

# 构建空间随机场
X = np.array([[i, j] for i in range(50) for j in range(50)])
kernel = RBF(length_scale=5.0)
field = GaussianProcessRegressor(kernel=kernel).sample_y(X, 1).flatten()
上述代码通过高斯过程采样生成空间场,length_scale 控制空间自相关范围,直接影响敏感性指标的响应尺度。实验表明,Sobol 指数对全局非线性更敏感,而 Morris 方法在识别主导变量方面效率更高。

4.4 实际案例:城市经济指标的空间自相关综合评估

在区域经济分析中,空间自相关能够揭示城市间经济发展的集聚特征。以中国主要城市的人均GDP数据为例,利用GeoDa软件计算全局Moran's I指数,评估其空间分布模式。
数据准备与空间权重矩阵构建
收集2022年全国省会城市及计划单列市的人均GDP数据,并建立基于邻接关系的空间权重矩阵。该矩阵反映城市之间的地理邻近性,是空间分析的基础输入。
# 构建空间权重矩阵(示例使用PySAL)
import libpysal as lp
w = lp.weights.Queen.from_shapefile('cities.shp')
w.transform = 'r'  # 行标准化
上述代码通过Queen邻接准则生成空间权重对象,并进行行标准化处理,确保各邻居影响权重一致。
空间自相关检验结果
计算得出全局Moran's I为0.387(p < 0.01),表明城市经济水平存在显著正向空间自相关,即“高-高”和“低-低”集聚现象明显。
指标Moran's Ip值期望值
人均GDP0.3870.008-0.021

第五章:构建精准空间自相关模型的技术总结与拓展方向

模型选择与权重矩阵优化
在实际应用中,空间权重矩阵的构建直接影响 Moran's I 和 Geary's C 的计算结果。采用邻接关系(Rook或Queen)时需结合地理边界数据进行拓扑分析。对于连续空间现象,使用反距离权重(IDW)更合理:

import numpy as np
from scipy.spatial.distance import pdist, squareform

# 计算坐标点间欧氏距离
coords = np.array([[x1, y1], [x2, y2], ...])
dist_matrix = squareform(pdist(coords))
# 构建反距离权重(避免除零)
weights = 1 / (dist_matrix + 1e-5)
np.fill_diagonal(weights, 0)
显著性检验与多重比较校正
进行全局与局部空间自相关分析后,应通过置换检验评估显著性。对LISA聚类图中的高-高、低-低区域执行Bonferroni校正,以控制假阳性率。
  • 设置随机置换次数为999次
  • 提取每次置换下的Moran's I值构建经验分布
  • 计算p值并应用FDR方法调整阈值
动态空间自相关的拓展应用
在城市空气质量监测中,引入时空核函数将传统LISA扩展为时空LISA(ST-LISA),可识别污染热点的传播路径。某长三角城市群案例显示,PM2.5浓度在冬季呈现显著的空间集聚演化趋势,且热点区沿风向迁移。
指标全局Moran's Ip-valueLISA聚类数
春季0.320.0036
冬季0.580.00111
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