Centos 下编译安装R和Rstudio Server

Centos 7.9环境下的操作

R语言的编译安装

1、R语言包的下载

1、1网页直接下载

 可以找到一些镜像网站点击进去，诸如

 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/

   点击想要的版本例如R-4.4.0.tar.gz 进行下载

1、2 利用wget进行获取下载

   wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/R-4.4.0.tar.gz

2、解压安装包

    个人习惯解压到/usr/local目录下
    tar -zxvf R-4.4.0.tar.gz -C /usr/local

3、依赖包的安装

yum install -y gcc gcc-gfortran gcc-c++ glibc-headers libreadline6-dev gfortran  readline-devel libXt-devel fonts-chinese tcl tcl-devel tclx tk tk-devel mesa-libGLU mesa-libGLU-devel bzip2-devel xz-devel.x86_64 pcre-devel libcurl libcurl-devel  texinfo.x86_64 texlive-pdftex-doc.noarch texlive

4、通过configure进行编译安装，时间大概15分钟

 cd /usr/local/R-4.4.0
    ./configure --enable-R-shlib --with-pcre1 --prefix=/opt/software/R-4.4.0
    make&&make install

make出现错误：error: cannot compile a simple Fortran program 是因为没有下载gfortran
yum install -y gcc-gfortran即可

5、R语言的环境变设置

 vim /etc/profile
    R_HOME=/usr/local/R-4.4.0
    PATH=$PATH:$R_HOME/bin
    source /etc/profile

6、检验R的成功安装

任何一个文件夹下打开终端，输入R

WARNING: ignoring environment value of R_HOME

R version 4.4.0 (2024-04-24) -- "Puppy Cup"
Copyright (C) 2024 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu

R是自由软件，不附带任何担保。
在某些条件下你可以将其自由分发。
用'license()'或'licence()'来看分发的详细条件。

R是个合作计划，有许多人为之做出了贡献.
用'contributors()'来看合著者的详细情况
用'citation()'会告诉你如何在出版物中正确地引用R或R程序包。

用'demo()'来看一些示例程序，用'help()'来阅读在线帮助文件，或
用'help.start()'通过HTML浏览器来看帮助文件。
输入'q()'退出R.

>

就表示R已经安装成功了。
2、Rstudio-server下载安装

2、1安装Rstudio（Server）
https://download2.rstudio.org/server/rhel8/x86_64/rstudio-server-rhel-2024.04.1-748-x86_64.rpm
我的操作系统是Centos7 按照官网提示的安装命令进行安装
wget https://download2.rstudio.org/server/rhel8/x86_64/rstudio-server-rhel-2024.04.1-748-x86_64.rpm
yum install rstudio-server-rhel-2024.04.1-748-x86_64.rpm

中间报：无法建立 SSL 连接。
wget在使用HTTPS协议时，默认会去验证网站的证书，而这个证书验证经常会失败。
在原命令加上"--no-check-certificate"选项，就能排除掉这个错误

中间报：无法建立 SSL 连接。
wget在使用HTTPS协议时，默认会去验证网站的证书，而这个证书验证经常会失败。
在原命令加上"--no-check-certificate"选项，就能排除掉这个错误
[root@Peter ~]# wget --no-check-certificate https://download2.rstudio.org/server/rhel8/x86_64/rstudio-server-rhel-2024.04.1-748-x86_64.rpm

2、2使用浏览器访问ip+8787进入rstudio

但所可能会报错，在浏览器地址栏输入ip+8787有可能打不开，是因为虽然配置了系统了环境变量，但是rstudio-server并没有办法读取到，所以还要配置rstudi-server的配置文件，指定R的环境——

[root@Peter ~]# cd /etc/rstudio/
[root@Peter rstudio]# ls
rserver.conf  rsession.conf  themes
[root@Peter rstudio]# cat rserver.conf
# Server Configuration File
rsession-which-r=/opt/software/R-4.4.0/bin/R  # the option of the R environment
www-port=8787 # the port of rstudio server
[root@Peter rstudio]# cat rsession.conf
# R Session Configuration File
rsession-which-r=/opt/software/R-4.4.0/bin/R  # the option of the R envionment
www-port=8787 # the port of rstudio server
如图所示的环境，然后重启rstudio-server：rstudio-server restart,再次ip+8787打开rstudio即可。

2、3安装R语言的包

在控制台输入R
>install.packages("devtools", dependencies = T)
会跳出一个连线cane ...
选择Chinese shanghai即可
安装devtools出现的错误
提示xml2安装时退出狀態的值不是0
解决方法 yum install libxml*
2、4安装REmap
library("devtools")
install_github('lchiffon/REmap')
安装Remap时出现的错误：
dependency ‘XML’ is not available for package ‘REmap’
解决方法:install.packages("XML")
2、5可视化教程注意的几点：
2、5、1使用百度api需要使用自己申请的ak
options(remap.ak = "")
2、5、2代码中需要添加一行
options(remap.js.web = T)  
不然打开浏览器时会提示找不到保存的html文件
2、5、3R的注释需要删掉，可能和浏览器不兼容