记录 | nnunetv2推理报错解决：RuntimeError: Some background workers are no longer alive

2025.4.11记录

        在使用训练好的nnunet进行推理时，出现了莫名其妙的报错“RuntimeError: Some background workers are no longer alive”。

        搜索网上的解决方案，发现没有直接可以适用于这种情况的解决办法，于是综合查到的各种办法，最后莫名其妙地又可以正常推理产生分割结果了。下面是目前正常推理的解决办法：

1. 在.bashrc 中最后一行添加

   export nnUNet_compile="False"

   然后保存

   之后在命令行中 source .bachrc

2. 更换numpy版本，从1.26.3换成1.26.4

3. 更换虚拟环境，从nnunetv2=2.2.1换成2.5.2

4. 测试命令nnUNetv2_predict -i /media/nii_data_0000/ -o /media/nnunet_predict -d 105 -c 3d_fullres -f 0 -npp 1 -nps 1 

后续：正常推理几分钟后又出现相同报错，只产生五个分割结果。

暂时无法解决报错，暂时搁置。

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2025.4.18记录

        由于仍然需要使用nnunet分割上面的数据集，在多次尝试使用nnunet指令测试后，报错依旧。但发现每次报错时系统内存都爆满，怀疑是因为nnunet代码对于内存优化太差，同时模型的分割类别数太多（100+），需要分割的数据又比较大（每个100MB左右），多种因素叠加导致无法分割此数据集。

        为了验证怀疑的报错原因，使用分割类别20+的nnunet模型预测分割此数据集，可以正常运行；使用报错的nnunet模型去预测其他较小数据集（每个几十MB左右），也可以正常运行，验证成立。到此报错也算另一种方式的解决了。