生信技能58 - 多线程运行更快的BWA比对(bwa-mem2)程序

多线程运行比对程序

将比对所需的各样本参数以字典数据格式存储至list_processes 列表中,通过max_process 参数设置最大并行分析线程数,对多样本实现并行分析,以节省分析时间。

比对程序采用bwa-mem2相比于bwa-mem速度更快,节省存储和内存空间,并且结果与bwa-mem一致。

bwa-mem2安装参考文章:

生信软件26 - BWA-MEM比对算法性能更好的bwa-mem2

# bwa_multi_threads.py
import time
import os
import concurrent.futures

class ThreadPoolExecutor
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

生信与基因组学

每一份鼓励是我坚持下去动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付:¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足,请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值