MapReduce详解

在了解了Hadoop的组建以及底层框架之后我们知道,Hadoop的底层是通过HDFS进行数据的存储,将数据存储到集群中然后调用其中的数据进行相应的计算,那么问题来了,谁来进行计算的操作呢?这个就是Hadoop的另外一个底层框架,也就是MapReduce,他在集群的作用就是负责进行数据的处理过程

为什么要使用mapreduce呢?因为mapreduce的核心是将用户编写的业务逻辑代码和自带的默认组件融合成一个完整的分布式应用程序然后提交到集群中进行处理,而大量的数据在单一的机器上进行运行是不可能的,硬件的限制决定了它根本完不成这个艰巨的任务,而且如果将一个单机的应用程序发放到一个集群中来分布式处理,那么势必会增加程序的复杂度和开发的难度,所以,综上考虑之后,引入了mapreduce计算框架,将分布式计算的复杂度交给框架来处理,开发人员就可以集中精力子业务逻辑上

MapReduce主要由JobTracker和TaskTracker(JobTracker负责资源管理和作业控制,TaskTracker负责任务的运行)组成,但在运行的过程中主要分为map和reduce两个阶段,map阶段就是将从jobtracker传入tasktracker的计算任务进行分解,分成一个个的小块,每一个小块都是以键值对的方式存在。对于多个map人物的输出,按照不同的分区copy到不同的节点上,然后根据键的值对map便利之后的键值对数据进行reduce聚合,相同键的放到一个reduce节点上(一般的map和reduce不在同一个节点上),然后对于reduce的输出的键值对写入HDFS中,但是在map和reduce的操作额过程中间会产生shuffle操作,将map分解后的数据先根据key进行分区,相同的key的值分配到一个分区中合并成一个文件,reduce去map段拉取的数据也是已经分区成一个个k-v格式的文件

MapReduce的运行过程

Map端:程序会根据inputFormat将输入的文件分割成splits,每一个splits会作为一条数据输入到maptask中,在经过map处理后会被存放到maptask的内存缓冲区中,并进行相应的分区,但是因为内存缓冲是有限制的(默认为0.8),当达到这个限制后,会将内存中的数据溢写到磁盘中,但是这个过程不会影响map结果的继续写入缓冲区,在溢写的过程中,会根据Key进行排序并将写入磁盘的数据合并成多个不同key的溢写文件,

Reduce端:当map的最终结果数据生成之后,每生成一条就会传入一个相应的reducetask中,当所有的map task执行完毕后也传入了reduce task中,reduce启动,进一步对数据根据key进行合并,最终将最后的计算机过输出到HDFS中

虽然MapReduce解决了对于大量数据的计算问题,但是依旧存在很严酷的问题,第一就是单点故障:因为mapreduce是有jobtracker从客户端拉取数据的,一旦jobtracker挂掉,那么整个集群与client的交互就会失效,那个整个作业也就会挂掉,任务执行失败。第二内存的硬件限制, JobTracker既负责资源管理又负责作业控制,当作业增多时,JobTracker内存是扩展的瓶颈,有限的资源会影响集群的运行效率。最后就是mapreduce 的计算机制决定了他需要在maptask执行完毕之后才会如致性reducetask,这一段时间,reduce一直处于空闲状态,却还需要占用资源,因为他需要拉取map端的数据,所以就造成了资源的空闲浪费。

对于mapreduce,最经典的应用就是wordcount案例

1、对于传入的数据先经过map操作转变成键值对的形式并存储在分区中

2、通过reduce操作,根据key合并成一个单独的文件

内容概要:本文详细介绍了扫描单分子定位显微镜(scanSMLM)技术及其在三维超分辨体积成像中的应用。scanSMLM通过电调透镜(ETL)实现快速轴向扫描,结合4f检测系统将不同焦平面的荧光信号聚焦到固定成像面,从而实现快速、大视场的三维超分辨成像。文章不仅涵盖了系统硬件的设计与实现,还提供了详细的软件代码实现,包括ETL控制、3D样本模拟、体积扫描、单分子定位、3D重建和分子聚类分析等功能。此外,文章还比较了循环扫描与常规扫描模式,展示了前者在光漂白效应上的优势,并通过荧光珠校准、肌动蛋白丝、线粒体网络和流感A病毒血凝素(HA)蛋白聚类的三维成像实验,验证了系统的性能和应用潜力。最后,文章深入探讨了HA蛋白聚类与病毒感染的关系,模拟了24小时内HA聚类的动态变化,提供了从分子到细胞尺度的多尺度分析能力。 适合人群:具备生物学、物理学或工程学背景,对超分辨显微成像技术感兴趣的科研人员,尤其是从事细胞生物学、病毒学或光学成像研究的科学家和技术人员。 使用场景及目标:①理解和掌握scanSMLM技术的工作原理及其在三维超分辨成像中的应用;②学习如何通过Python代码实现完整的scanSMLM系统,包括硬件控制、图像采集、3D重建和数据分析;③应用于单分子水平研究细胞内结构和动态过程,如病毒入侵机制、蛋白质聚类等。 其他说明:本文提供的代码不仅实现了scanSMLM系统的完整工作流程,还涵盖了多种超分辨成像技术的模拟和比较,如STED、GSDIM等。此外,文章还强调了系统在硬件改动小、成像速度快等方面的优势,为研究人员提供了从理论到实践的全面指导。
内容概要:本文详细介绍了基于Seggiani提出的渣层计算模型,针对Prenflo气流床气化炉中炉渣的积累和流动进行了模拟。模型不仅集成了三维代码以提供气化炉内部的温度和浓度分布,还探讨了操作条件变化对炉渣行为的影响。文章通过Python代码实现了模型的核心功能,包括炉渣粘度模型、流动速率计算、厚度更新、与三维模型的集成以及可视化展示。此外,还扩展了模型以考虑炉渣组成对特性的影响,并引入了Bingham流体模型,更精确地描述了含未溶解颗粒的熔渣流动。最后,通过实例展示了氧气-蒸汽流量增加2%时的动态响应,分析了温度、流动特性和渣层分布的变化。 适合人群:从事煤气化技术研究的专业人士、化工过程模拟工程师、以及对工业气化炉操作优化感兴趣的科研人员。 使用场景及目标:①评估不同操作条件下气化炉内炉渣的行为变化;②预测并优化气化炉的操作参数(如温度、氧煤比等),以防止炉渣堵塞;③为工业气化炉的设计和操作提供理论支持和技术指导。 其他说明:该模型的实现基于理论公式和经验数据,为确保模型准确性,实际应用中需要根据具体气化炉的数据进行参数校准。模型还考虑了多个物理场的耦合,包括质量、动量和能量守恒方程,能够模拟不同操作条件下的渣层演变。此外,提供了稳态求解器和动态模拟工具,可用于扰动测试和工业应用案例分析。
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