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原创 linux 目录结构查看 tree

目前很多时候都会用到ai来为我们提供一个脚本处理方案,来进行批量化处理,这时候需要对一些已有的复杂文件目录进行描述,告诉ai后,ai才能精确的提供对应脚本,如果子目录过多,便不好准确描述,这时候可以用tree命令,展示当前目录结构,然后复制给ai。

2026-06-12 10:21:11 184

原创 从NCBI上直接下载数据到linux服务器

先准备accession文件(accession.txt),是一个txt文件,里面只一列accession号即可。用于把 SRA accession 提取为 FASTQ 或 FASTA 格式,它是。类似,适合已知链接的文件下载。获取,不过对于非常大的数据,直接 HTTP 下载可能会比较慢。2.下载单个基因组(利用目标基因的accession号)1.安装datasets(通过conda,简单快捷)2. 下载单个 SRR 数据。3. 批量下载 SRR 数据。4.只下载指定文件类型。

2026-06-02 08:49:47 235

原创 有时候我需要暂停程序,协调进程

【代码】有时候我需要暂停程序,协调进程。

2026-05-19 13:11:48 187

原创 两台服务器间的文件传输

有时候,我需要将文件在不同主机间传输,这些文件通常很大,使用文件管理类软件比较慢,甚至卡掉,除了物理挂载硬盘传输外,就是使用如下命令了。1.scp是的缩写,用于通过 SSH 在本地和远程服务器之间传输文件。

2026-05-19 09:28:55 20

原创 查看磁盘空间-linux

查看磁盘空间大小

2026-05-18 11:21:07 28

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