cora数据集示例项目学习图神经网络

原创

已于 2023-04-05 12:28:31 修改 · 1.1k 阅读

1 ·

CC 4.0 BY-SA版权

文章标签：

#学习 #神经网络 #深度学习

于 2023-02-18 00:09:08 首次发布

本文是关于EEG脑电图的研究，包括对多个相关论文的阅读分析，如基于图神经网络的情绪识别方法，以及对Cora数据集的使用，展示了一个使用GAT在Cora数据集上进行训练的图神经网络模型实现。

下面所有博客是个人对EEG脑电的探索，项目代码是早期版本不完整，需要完整项目代码和资料请私聊。

数据集
1、脑电项目探索和实现(EEG) (上)：研究数据集选取和介绍SEED
相关论文阅读分析：
1、EEG-SEED数据集作者的—基线论文阅读和分析
2、图神经网络EEG论文阅读和分析：《EEG-Based Emotion Recognition Using Regularized Graph Neural Networks》
3、EEG-GNN论文阅读和分析：《EEG Emotion Recognition Using Dynamical Graph Convolutional Neural Networks》
4、论文阅读和分析:Masked Label Prediction: Unified Message Passing Model for Semi-Supervised Classification
5、论文阅读和分析：《DeepGCNs: Can GCNs Go as Deep as CNNs?》
6、论文阅读和分析： “How Attentive are Graph Attention Networks?”
7、论文阅读和分析：Simplifying Graph Convolutional Networks
8、论文阅读和分析：LightGCN: Simplifying and Powering Graph Convolution Network for Recommendation
9、图神经网络汇总和总结
相关实验和代码实现：
1、用于图神经网络的脑电数据处理实现_图神经网络脑电
2、使用GCN训练和测试EEG的公开SEED数据集
3、使用GAT训练和测试EEG公开的SEED数据集
4、使用SGC训练和测试SEED数据集
5、使用Transformer训练和测试EEG的公开SEED数据集_eeg transformer
6、使用RGNN训练和测试EEG公开的SEED数据集
辅助学习资料：
1、官网三个简单Graph示例说明三种层次的应用_graph 简单示例
2、PPI数据集示例项目学习图神经网络
3、geometric库的数据处理详解
4、NetworkX的dicts of dicts以及解决Seven Bridges of Königsberg问题
5、geometric源码阅读和分析：MessagePassin类详解和使用
6、cora数据集示例项目学习图神经网络
7、Graph 聚合
8、QM9数据集示例项目学习图神经网络
9、处理图的开源库

部分代码如下:

cora数据集：

Cora数据集包含2708篇科学出版物， 5429条边，总共7种类别。数据集中的每个出版物都由一个 0/1 值的词向量描述，表示字典中相应词的缺失/存在。该词典由 1433 个独特的词组成。意思就是说每一个出版物都由1433个特征构成，每个特征仅由0/1表示。

数据集组成：

ind.cora.x : 训练集节点特征向量，保存对象为：scipy.sparse.csr.csr_matrix，实际展开后大小为： (140, 1433)
ind.cora.tx : 测试集节点特征向量，保存对象为：scipy.sparse.csr.csr_matrix，实际展开后大小为： (1000, 1433)
ind.cora.allx : 包含有标签和无标签的训练节点特征向量，保存对象为：scipy.sparse.csr.csr_matrix，实际展开后大小为：(1708, 1433)，可以理解为除测试集以外的其他节点特征集合，训练集是它的子集
ind.cora.y : one-hot表示的训练节点的标签，保存对象为：numpy.ndarray
ind.cora.ty : one-hot表示的测试节点的标签，保存对象为：numpy.ndarray
ind.cora.ally : one-hot表示的ind.cora.allx对应的标签，保存对象为：numpy.ndarray
ind.cora.graph : 保存节点之间边的信息，保存格式为：{ index