Day3-linux环境下的安装

本文介绍了如何在Linux系统中安装和配置miniconda,包括激活conda环境、添加中国镜像源以提高下载速度,以及使用conda命令列表软件、安装FastQC并检查其安装成功的步骤,最后提到通过帮助文档验证软件的方法。
部署运行你感兴趣的模型镜像

一.安装和配置miniconda

1.激活conda

代码:source ~/.bashrc

2.添加镜像(加快下载速度)

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes

二.使用conda

1. 查看当前服务器上安装的所有软件列表 conda list

2. 安装软件 conda install fastqc -y

遇见问题一律回答yes

3.确认fastqc软件是否安装成功

确认方法:软件的帮助文档

fastqc --help

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