GreatSQL启动崩溃:jemalloc依赖缺失问题排查

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GreatSQL启动崩溃:jemalloc依赖缺失问题排查

故障现象:

之前协助用户安装 GreatSQL 测试环境时,遇到一个 case,数据库初始化时没有报错,但是使用mysqld_safe去启动,会直接 crash ,详情报错如下:

.....
<jemalloc>: Error in munmap():Invalid argument
2025-02-13T06:32:20.617961Z [System][MY-013576][InnoDB]InnoDB initialization has satrt.
<jemalloc>: Error in munmap():Invalid argument
2025-02-13T06:32:20Z - mysqld got signal 11;
most likely, you have hit a bug,but this error can also be caused by malfunctioning hardware.
.....

用户机器系统为 kylin uos-PC 4.19.17 arm64-desktop ,aarch 64 架构, 配置8C8GB。

问题分析:

查看系统报错日志 tail -n 10000 /var/log/messages | grep memory 没有明显报错;

网上查阅资料,mysqld got signal 11 报错的相关信息很少,而且每个遇到signal 11 导致crash 的原因并不相同,有的是磁盘满了,有的是内存问题等等问题。

我把重点放在了 <jemalloc>:Error in munmap():Invalid argument 上。查阅jemalloc 官网,得知jemalloc 是一个内存管理器,可以优化内存分配策略、减少内存碎片、提升性能等方面。

查看GreatSQL源码,发现在 mysqld_safe 上找到了 jemalloc 的踪迹:

...
# Add jemalloc to ld_preload if no other malloc forced - needed for TokuDB 
#
 if test $load_jemalloc -eq 1 
 then   
     for libjemall in "${MY_BASEDIR_VERSION}/lib/mysql" "/usr/lib64" "/usr/lib/x86_64-linux-gnu" "/usr/lib"; do     
     if [ -r "$libjemall/libjemalloc.so.1" ]; then                    add_mysqld_ld_preload "$libjemall/libjemalloc.so.1"       
     break     
     fi     
  done
fi 

进一步查看源码,发现参数 load_jemalloc=1 ,也就是说使用 mysqld_safe 去启动GreatSQL 时,默认使用jemalloc 进行内存管理。

查看用户机器的jemalloc 的信息:

strings lib/libjemalloc.so | grep JEMALLOC_VERSION ,发现没有信息打印;

再次尝试全局查找:

find / -name jemalloc* , 没有找到相关软件。

至此断定,用户的PC端没有 jemalloc 的相关依赖。初步断定是由于缺少软件依赖造成的GreatSQL 服务没法启动。

问题调试

不妨假设如果不使用jemalloc 而改用其他内存管理方式呢?

尝试将 load_jemalloc=1改成 load_jemalloc=0 ,继续使用 mysqld_safe 发现数据库能正常启动。

# ps -ef | grep greatsql
root      4521     1  0 15:07 ?        00:00:00 /bin/sh /greatsql/svr/greatsql/bin/mysqld_safe --defaults-file=/greatsql/conf/greatsql.cnf
greatsql   6176  4521  5 15:07 ?        00:00:02 /greatsql/svr/greatsql/bin/mysqld --defaults-file=/greatsql/conf/greatsql.cnf --basedir=/greatsql/svr/greatsql --datadir=/greatsql/dbdata/data3306/data --plugin-dir=/greatsql/svr/greatsql/lib/plugin --user=greatsql --log-error=/greatsql/logs/error3306.log --pid-file=/greatsql/dbdata/data3306/data/greatsql.pid --socket=/greatsql/dbdata/data3306/data/greatsql.sock --port=3306

继续查看源码,发现如果将load_jemalloc 更改成disable (value=0),GreatSQL 会使用 glibc 默认的ptmalloc 进行内存分配。

那如果改用 mysqld方式启动,不使用 mysqld_safe 去启动呢?

  1. 更改回 mysqld_safe 的默认值: load_jemalloc=1 (控制变量)
  2. 使用 mysqld --defaults-file=greatsql.cnf & 去启动

发现数据库也能正常启动。

这时候不妨回顾一下mysqld_safe和mysqld的关系:

mysqld_safe 是一个在Unix上启动GreatSQL服务器推荐的方式,可以安全地启动,监控和重启mysqld 进程。

所以如果不指定 malloc_lib 的方式,mysqld使用 glibc 默认ptmalloc进行内存分配。

这时候就有疑问了,为了适配多环境,为什么不继续使用glibc默认的ptmalloc而是使用jemalloc 呢?

网上资料大多都是推荐摒弃 glibc 原生的 ptmalloc,而改用 jemalloc 或者 tcmalloc 作为默认分配器。ptmalloc 的主要问题是内存浪费、内存碎片、以及加锁导致的性能问题。

因为笔者对内存分配原理这块不是很了解,对这一块感兴趣的可以在网上查找相关的资料研究。

  • ptmalloc、tcmalloc与jemalloc对比分析:https://www.cyningsun.com/07-07-2018/memory-allocator-contrasts.html

而根据以上的分析,更加推荐在缺少GreatSQL 相关软件依赖时 ,手动安装软件(如jemalloc 等)去启动GreatSQL,以提升数据库性能。

总结

  • 对数据库必须的依赖建议放在前期检查里,可以参考相关文章:openEuler、龙蜥Anolis、统信UOS三大主流操作系统下编译GreatSQL二进制包:https://www.greatdb.com/Home/news/news_1/id/501.html
  • mysqld_safe 默认使用jemalloc 进行内存分配
  • mysqld使用glibc 默认的ptmalloc 进行内存分配
  • 有时候遇到没有头绪的故障时,可以尝试从源码找到蛛丝马迹,进行问题排查和调试
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