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RSS订阅原创 论文笔记十【Structure-based drug design by denoising voxel grids】
大家好，今天给大家介绍的论文是《Structure-based drug design by denoising voxel grids》，发表在去年的ICML会议上。之前已经介绍过当前比较主流的自回归模型与扩散模型来生成分子，今天给大家介绍体素化网格生成分子，这是一种比较早期的方法，是基于卷积神经网络CNN的，但本文将体素网格巧妙地融合了扩散模型之后，达到效果的提升。
2025-07-14 18:16:10
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原创 论文笔记九【Molecular substructure tree generative model for de novo drug design】
今天给大家介绍的论文是《Molecular substructure tree generative model for de novo drug design》，发表在2022年的一区期刊Briefings in Bioinformatics。上次和大家介绍的是扩散模型生成分子，这次介绍一下自回归模型生成分子。
2025-07-14 17:59:44
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原创 论文笔记八【3D equivariant diffusion for target-aware molecule generation and affinity prediction】
今天给大家介绍的论文是《3D equivariant diffusion for target-aware molecule generation and affinity prediction》，发表在2023年的ICLR会议中，据文章所述，这是首个用于靶点感知药物设计的概率扩散模型。
2025-07-14 17:51:57
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原创 论文笔记七【A Method for Predicting Protein Complexes from Dynamic Weighted PPI Network】
今天我给大家介绍一个基于鸽子优化算法的DBSCAN聚类算法，应用于蛋白质相互作用网络复合物挖掘。
2025-03-12 09:22:16
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原创 论文笔记六【KGML-xDTD: A Knowledge Graph-based Machine Learning Framework for Drug Treatment Prediction】
今天我想给大家介绍的，是一个基于知识图谱的机器学习框架，用于药物再利用预测和作用机制解释——KGML-xDTD: A Knowledge Graph-based Machine Learning Framework for Drug Treatment Prediction and Mechanism Description
2025-02-20 00:42:05
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原创 论文笔记四【边缘计算结合区块链】
边缘计算如何与区块链结合呢？当前问题+具体案例+未来研究方向。边缘计算是一种分布式计算框架，它将计算和数据存储从中心（比如大型数据中心或云端）推向网络的“边缘”，即设备或终端更接近用户或数据源的地方，例如 IoT 设备或本地边缘服务器。这种与源头数据的接近可以带来强大的优势，包括更快的洞察、更短的响应时间和更好的带宽可用性。
2024-12-05 10:33:31
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原创 论文笔记三【Accurate structure prediction ofbiomolecular interactions with AlphaFold 3】
今天我给大家介绍的文章是《Accurate structure prediction of biomolecular interactions with AlphaFold 3》。也就是今年斩获诺贝尔化学奖的AlphaFold2的升级版，研究领域是生物分子结构预测，而不仅仅是蛋白质结构预测。于今年5月8日在Nature发表，当时是没有开源的，上个月AF3开源了，所以想和大家分享这篇论文。
2024-12-03 17:51:12
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原创 论文笔记二【CBGBench: Fill in the Blank of Protein-Molecule Complex Binding Graph】
今天我给大家介绍的文章是《CBGBench: Fill in the Blank of Protein-Molecule，Complex Binding Graph》。研究方向是分子设计与生成。这篇文章投在了明年的ICLR会议，目前是审稿阶段。作者来自西湖大学李子青实验室，这个实验室主要关注AI基础研究和AI跨界研究，目前的国家基金项目都集中在蛋白质结构预测与设计上。
2024-11-06 19:47:21
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原创 论文笔记一【An algorithmic framework for synthetic cost-aware decision making in molecular design】
An algorithmic framework for synthetic cost-aware decision making in molecular designNature Computational Science ( IF 12.0 ) Pub Date : 2024-06-17一作：Jenna C. Fromer，二作：Connor W. Coley，来自MIT
2024-09-28 22:20:03
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空空如也
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