在医学图像处理领域,将标签图叠加到原始图像上是非常常见的操作。本文将介绍如何使用ITK库实现该功能。在处理过程中需要加载原始图像和标签图,并将它们重叠在一起进行可视化。
首先,我们需要安装ITK库,并导入必要的模块:
!pip install itk
import itk
接下来,我们可以使用ITK的ReadImage()
方法加载原始图像和标签图:
inputImage = itk.imread("original_image.nii.gz", itk.F)
labelImage = itk.imread("label_image.nii.gz", itk.UC)
在这里,itk.F
表示使用float
类型读取原始图像,itk.UC
表示使用unsigned char
类型读取标签图。
然后,我们可以使用Compose()
方法将原始图像和标签图结合起来。在这个例子中,我们使用了一个透明度值为0.5来展示标签图在原始图像上的叠加效果。
RGBPixelType = itk.RGBPixel[itk.F]
RGBImageType = itk.Image[RGBPixelType, 2]
alpha_channel = itk.Image[itk.UC, 2].New()
alpha_channel.SetRegions(inputImage.GetLargestPossibleRegion())
alpha_channel.