LAMMPS生成粗糙表面的in文件脚本——Matlab实现

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本文介绍了如何用Matlab编写脚本生成LAMMPS的in文件,以模拟粗糙表面的材料。通过生成原子坐标、定义晶格参数,创建的'in'文件可用于后续的动力学模拟。

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LAMMPS生成粗糙表面的in文件脚本——Matlab实现

在本文中,我们将介绍如何使用Matlab编写脚本来生成用于LAMMPS的in文件,以模拟具有粗糙表面的材料。我们将逐步介绍生成自定义表面的过程,并提供相应的Matlab源代码。

LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)是一款用于原子和分子动力学模拟的开源软件包。它提供了广泛的功能和灵活性,可以模拟各种材料的动力学行为。

以下是我们介绍的主要步骤及相应的Matlab源代码:

  1. 生成原子坐标:
    首先,我们需要生成原子的初始坐标。我们可以使用Matlab中的随机数函数来生成具有一定范围的坐标。下面是一个示例代码,生成了100个原子以及其对应的x、y、z坐标:
num_atoms = 100;  % 原子数量
x = rand
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