GROMACS的安装以及部分常见报错

开始安装之前需要准备一些东西（这些的具体安装方式下面会讲的，不过喜欢自己配置环境的话也可以手动捣鼓）：

• 1.可以运行的Linux机器（下面说明用到的都是Centos 7.x的版本，另外我用到的是阿里云的云服务器）

• 2.1 cmake3（下面教程有傻瓜版安装。手动安装可以参考https://blog.youkuaiyun.com/zjb18741809273/article/details/119192553；不过编译gromacs还需要Python3的支持，Linux系统大多自带Python2，所以手动的大佬可能还需要安装Python3.6.x以上的版本，可以参考https://blog.youkuaiyun.com/L_15156024189/article/details/84831045（上面两个都是保姆级教程了））

  2.2 gcc

• 3.1 傅里叶变换软件fftw（http://fftw.org/index.html（里面也有安装的引导，如果想搞明白每个设置的意义可以看一下，单纯为了安装的话跟着下面的引导就好了））

  3.2 gromacs（http://www.gromacs.org/（里面也有安装教程https://manual.gromacs.org/documentation/current/install-guide/ind