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AI摘要
本文详细指导如何安装PLUMED并将其与Gromacs结合，包括PLUMED的下载、配置、环境变量设置，以及Gromacs2023版本的补丁安装。还提到使用时可能出现的MPI问题及其解决方案。
本文意在指导读者安装 PLUMED 及与其适配的 Gromacs。需要注意的是，我们需要先安装好 PLUMED，然后利用其对 Gromacs 安装包进行处理，随后才可以编译出可以使用 PLUMED 的 Gromacs 版本。
PLUMED官网为 https://www.plumed.org/download，请前往此处下载。然后解压：
tar -xzvf plumed-2.9.0.tgz
cd plumed-2.9.0/
运行（$PLUMEDDIR是你的 PLUMED 安装目录）：
./configure --enable-mpi --prefix=$PLUMEDDIR
make
make install
编译完成后配置环境变量，在~/.bashrc中添加：
# plumed
export PATH=$PATH:$PLUMEDDIR/bin
export PATH</从零开始：PLUMED与GROMACS整合安装全攻略
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