LAMMPS模拟:甲烷与水的竞争吸附及循环(Matlab实现)

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本文介绍了如何使用LAMMPS和Matlab结合,模拟甲烷与水分子在表面上的竞争吸附及循环过程。通过定义模拟系统、控制LAMMPS运行的Matlab脚本,研究不同条件下吸附行为的变化。循环模拟有助于理解吸附行为,为材料科学和化学研究提供理论依据。

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LAMMPS模拟:甲烷与水的竞争吸附及循环(Matlab实现)

引言:
吸附是一种广泛应用于材料科学和化学领域的重要现象。在研究吸附行为时,了解不同气体分子之间的相互作用是至关重要的。本文将介绍如何使用LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)软件包,在Matlab环境下实现甲烷和水分子的竞争吸附以及循环过程。

材料和方法:
LAMMPS是一种广泛应用于分子动力学模拟的开源软件包,它被用于模拟原子、分子和其他粒子集合的系统。在本研究中,我们将结合Matlab和LAMMPS来模拟甲烷和水分子在表面上的吸附过程。

首先,我们需要定义模拟系统的结构。在LAMMPS中,可以通过创建数据文件来定义原子的初始位置、速度和力场参数。以下是一个示例数据文件:

# 系统设置
units	real
atom_style	full

# 定义原子类型
read_data system.data

# 力场参数
pair_style lj/cut/coul/long 10.0
bond_style harmonic
angle_style harmonic

# 定义模拟盒子尺寸
region	box block 0 10 0 10 0 10
create_box	1 box
create_atoms	1 box

# 定义原子间相互作用参数
mass	1	12.011
pair_coeff	1	1	0.0660	3.5000
bond_coeff	1	450.0000	1.0900
angle_coeff	1	55.0000	109.5000

上述代码中,我们定义了一个正方

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