bfile的使用

bfile字段实际的文件存储在文件系统中,字段中存储的是文件定位指针.bfile对

oracle来说是只读的,也不参与事务性控制和数据恢复

bfile的基本操作如下:


1.先在oracle数据库中下面我们建立一个目录别名,用于将文件定位指针映射到文

件系统:

create DIRECTORY 'tmpdir' AS '/tmp';
tmpdir表示逻辑目录名,'/tmp'是实际目录。 注意该目录oracle应该有读权限

然后根据需要授权
GRANT READ ON DIRECTORY bfile_dir1 TO scott;
建立一个含有bfile字段的表
create table bfiletest(id number(3), fname bfile);

2.插入数据
这里需要使用bfilename来进行bfile字段的insert 或者 update操作

INSERT INTO bfiletest
VALUES (1, BFILENAME ('tmpdir', 'tmptest'));


bfilename的参数1是DIRECTORY名,参数2是文件名。注意:这一行中插入的是

一个指向/tmp/tmptest的文件定位指针映射,不是文件本身。

3.读取bfile

通过使用dbms_lob包进行可以对bfile读入到blob/clob对象中操作(只读)

CREATE OR REPLACE PROCEDURE loadLOBFromBFILE_proc IS
Dest_loc BLOB;
Src_loc BFILE := BFILENAME('tmpdir', 'tmptest');

BEGIN
SELECT blob_col INTO Dest_loc FROM aBLOBtable
WHERE ID= 111
FOR UPDATE;

/* 如果bfile文件实际存在 */
IF (DBMS_LOB.FILEEXISTS(Src_loc) != 0)
THEN
/* 打开bfile源文件 */
DBMS_LOB.OPEN(Src_loc, DBMS_LOB.LOB_READONLY);
/* 打开目标blob: */
DBMS_LOB.OPEN(Dest_loc, DBMS_LOB.LOB_READWRITE);
/*从文件中装入 */
DBMS_LOB.LOADFROMFILE(Dest_loc, Src_loc,DBMS_LOB.GETLENGTH(Src_loc));
/* 记得关闭: */
DBMS_LOB.CLOSE(Dest_loc);
DBMS_LOB.CLOSE(Src_loc);
COMMIT;
END IF;
EXCEPTION
WHEN OTHERS THEN
DBMS_OUTPUT.PUT_LINE('Operation failed');

END;


会话能打开多少个文件有init参数SESSION_MAX_OPEN_FILES决定
文件大小由OS决定, 32位的文件系统为每个文件2gb或4gb

其它请参阅oracle联机文档.
内容概要:本文详细介绍了扫描单分子定位显微镜(scanSMLM)技术及其在三维超分辨体积成像中的应用。scanSMLM通过电调透镜(ETL)实现快速轴向扫描,结合4f检测系统将不同焦平面的荧光信号聚焦到固定成像面,从而实现快速、大视场的三维超分辨成像。文章不仅涵盖了系统硬件的设计与实现,还提供了详细的软件代码实现,包括ETL控制、3D样本模拟、体积扫描、单分子定位、3D重建和分子聚类分析等功能。此,文章还比较了循环扫描与常规扫描模式,展示了前者在光漂白效应上的优势,并通过荧光珠校准、肌动蛋白丝、线粒体网络和流感A病毒血凝素(HA)蛋白聚类的三维成像实验,验证了系统的性能和应用潜力。最后,文章深入探讨了HA蛋白聚类与病毒感染的关系,模拟了24小时内HA聚类的动态变化,提供了从分子到细胞尺度的多尺度分析能力。 适合人群:具备生物学、物理学或工程学背景,对超分辨显微成像技术感兴趣的科研人员,尤其是从事细胞生物学、病毒学或光学成像研究的科学家和技术人员。 使用场景及目标:①理解和掌握scanSMLM技术的工作原理及其在三维超分辨成像中的应用;②学习如何通过Python代码实现完整的scanSMLM系统,包括硬件控制、图像采集、3D重建和数据分析;③应用于单分子水平研究细胞内结构和动态过程,如病毒入侵机制、蛋白质聚类等。 其他说明:本文提供的代码不仅实现了scanSMLM系统的完整工作流程,还涵盖了多种超分辨成像技术的模拟和比较,如STED、GSDIM等。此,文章还强调了系统在硬件改动小、成像速度快等方面的优势,为研究人员提供了从理论到实践的全面指导。
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