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RSS订阅原创 Seurat版本到底如何通用（记录疑问（未解决
>未解决V4版本SeuratObject和DoubletFinder不通用问题：最新版DoubletFinder适配V5版本SeuratObject（DoubletFinder::ParamSweep），旧版本DoubletFinder（DoubletFinder::ParamSweep_v3）无法成功安装并调用该函数。1. 关于DoubletFinder::ParamSweep_v3。正使用V4版本的Seurat。
2024-05-27 15:22:48
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原创 在linux系统、conda环境下配置R软件及R包（内含fatal error: glpk.h: No such file or directory不完全解决办法:(
可以看到，我一共想安装9个R包，最终安装成功并能顺利library调用的只有5个！再次调用Seurat：（== 你还记得安装htmltools是为了Seurat吗（（前情提要：服务器无sudo权限，无法修改默认目录以及各种Path。那把R包安装路径里的文件夹删掉再重新装呢。在安装BiocManager时也容易遇到千奇百怪的报错：！也找到了大佬的trouble shooting：……（其实完全没有装好，但是我装不下去了==）直接开装最难搞也是最有用的Seurat包：！注意了，Seurat包首字母可要大写啊。
2024-04-10 14:52:54
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原创 从蛋白组数据到代谢通路（内附倾斜火山图sp_scatterplot、cnetplot、rich factor计算）
已知naive T可以激活成Tx，我们想知道这个激活过程中哪些基因差异表达了，并富集出差异表达基因所在的代谢通路。大家感兴趣搜关键词都能找到。原始数据及文献不做展示，但相似的数据格式应该都可以适配本篇。关于生信学习推荐：生信技能树、生信菜鸟团、生信七点半等等等等。如果遇到无法安装的，尝试下载压缩包到本地安装。【Q12345_Tbx21】蛋白编号_基因名。不算教程 ，只是最近在做的项目分享~【Tx_sam1】细胞类型_样本名。数据格式：Mus muscle。
2023-12-31 15:38:36
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原创 Rstudio安装R包报错：Warning in system(cmd) : ‘make‘ not found
Rstudio无法安装AMORE包，报错：Warning in system(cmd) : 'make' not foundERROR: compilation failed for package 'AMORE'，解决办法：安装RTools
2021-12-01 22:17:09
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空空如也
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