Segmentation of Head and Neck Tumours Using Modified U-net

Abstract
提出了一种新的用于磁共振成像(MRI)头颈癌自动分割的神经网络。所提出的神经网络是基于U-net的,它结合不同分辨率的特征来实现医学图像的端到端定位和分割。在这项工作中,扩展卷积被引入到U-net中,以获得更大的感受野,从而提取多尺度特征。此外,该网络使用Dice失来减少类之间的不平衡。该算法在真实的MRI数据上进行了训练和测试。交叉验证结果表明,新网络在头颈部肿瘤分割方面比原始Unet高出5%(Dice分数)。
Keywords
MRI data, Head and neck cancer, U-net, dilated convolution, semantic segmentation
Introduction
根据世界卫生组织[1]的数据,2015年全球约有880万人死于癌症。放射治疗和手术一起提供了根治性治疗的主要选择。放射治疗计划是一个复杂而漫长的过程,需要对复杂的癌症区域进行详细的界定。这个区域被称为总肿瘤体积(GTV)。该区域的定义是准确和有效的放射治疗计划的基础。自动勾画方法的发展可以减少人工勾画肿瘤的内部和外部差异性,为临床肿瘤学家减轻工作量和改善放射治疗提供客观可靠的帮助[2]。
图1(a)显示舌根肿瘤的T1加权钆增强头颈部MR图像。众所周知,肿瘤区域边界模糊,与邻近组织没有明显区别。此外,在头部和颈部,有一些区域和组织具有与肿瘤相似的特征(强度、位置),如淋巴结;这些区域和组织可能会产生假阳性。此外,如图1(b)所示,MRI数据的伪影很明显,

研究提出了一种结合U-Net与扩张卷积的神经网络,针对头颈癌MRI图像的肿瘤分割。通过扩展感受野和Dice Loss解决类间不平衡问题,实现在真实数据集上的显著性能提升,较原始U-Net Dice分数提高5%。
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