- 博客(2)
- 收藏
- 关注
原创 基于R语言计算基因型填充准确性
在计算这三项指标之前,笔者会用plink软件将基因型文件转换为raw格式,因此,以下公式都是基于raw格式的基因型文件进行计算的。首先去除基因型文件中的无用信息,其中imputed_genotype为填充基因型文件,true_genotype为真实基因型文件。一般来说,检测基因型填充准确性的指标主要有三个,分别是基因型一致性、相关系数以及r。至此,如有错误,敬请指正。总共填充的基因型个数。正确填充的基因型个数。
2025-03-15 14:43:49
1246
1
空空如也
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人
RSS订阅