HDFS小文件的合并优化
我们都知道,HDFS设计是用来存储海量数据的,特别适合存储TB、PB量级别的数据。但是随着时间的推移,HDFS上可能会存在大量的小文件,这里说的小文件指的是文件大小远远小于一个HDFS块(128MB)的大小;HDFS上存在大量的小文件至少会产生以下影响:
消耗NameNode大量的内存
延长MapReduce作业的总运行时间
本文将介绍如何在MapReduce作业层面上将大量的小文件合并,以此减少运行作业的Map Task的数量;关于如何在HDFS上合并这些小文件
Hadoop内置提供了一个 CombineFileInputFormat 类来专门处理小文件,其核心思想是:根据一定的规则,将HDFS上多个小文件合并到一个 InputSplit中,然后会启用一个Map来处理这里面的文件,以此减少MR整体作业的运行时间。
CombineFileInputFormat类继承自FileInputFormat,主要重写了List getSplits(JobContext job)方法;这个方法会根据数据的分布,mapreduce.input.fileinputformat.split.minsize.per.node、mapreduce.input.fileinputformat.split.minsize.per.rack以及mapreduce.input.fileinputformat.split.maxsize 参数的设置来合并小文件,并生成List。其中mapreduce.input.fileinputformat.split.maxsize参数至关重要:
如果用户没有设置这个参数(默认就是没设置),那么同一个机架上的所有小文件将组成一个InputSplit,最终由一个Map Task来处理;
如果用户设置了这个参数,那么同一个节点(node)上的文件将会组成一个InputSplit。
同一个 InputSplit 包含了多个HDFS块文件,这些信息存储在 CombineFileSplit 类中,它主要包含以下信息:
private Path[] paths;
private long[] startoffset;
private long[] lengths;
private String[] locations;
private long totLength;
从上面的定义可以看出,CombineFileSplit类包含了每个块文件的路径、起始偏移量、相对于原始偏移量的大小以及这个文件的存储节点,因为一个CombineFileSplit包含了多个小文件,所以需要使用数组来存储这些信息。
CombineFileInputFormat是抽象类,如果我们要使用它,需要实现createRecordReader方法,告诉MR程序如何读取组合的InputSplit。内置实现了两种用于解析组合InputSplit的类:org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.CombineTextInputFormat 和 org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.CombineSequenceFileInputFormat,我们可以把这两个类理解是 TextInputFormat 和 SequenceFileInputFormat。为了简便,这里主要来介绍CombineTextInputFormat。
在 CombineTextInputFormat 中创建了 org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.CombineFileRecordReader,具体如何解析CombineFileSplit中的文件主要在CombineFileRecordReader中实现。
CombineFileRecordReader类中其实封装了TextInputFormat的RecordReader,并对CombineFileSplit中的多个文件循环遍历并读取其中的内容,初始化每个文件的RecordReader主要在initNextRecordReader里面实现;每次初始化新文件的RecordReader都会设置mapreduce.map.input.file、mapreduce.map.input.length以及mapreduce.map.input.start参数,这样我们可以在Map程序里面获取到当前正在处理哪个文件。
现在我们就来看看如何使用CombineTextInputFormat类,如下:
package com.hqdps.hadoop.mr.merge;
import org.apache.commons.logging.Log;
import org.apache.commons.logging.LogFactory;
import org.apache.hadoop.conf.Configuration;
import org.apache.hadoop.conf.Configured;
import org.apache.hadoop.fs.FileStatus;
import org.apache.hadoop.fs.FileSystem;
import org.apache.hadoop.fs.Path;
import org.apache.hadoop.io.LongWritable;
import org.apache.hadoop.io.NullWritable;
import org.apache.hadoop.io.Text;
import org.apache.hadoop.mapreduce.Job;
import org.apache.hadoop.mapreduce.Mapper;
import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.CombineTextInputFormat;
import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.FileInputFormat;
import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.output.FileOutputFormat;
import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.output.TextOutputFormat;
import org.apache.hadoop.util.Tool;
import org.apache.hadoop.util.ToolRunner;
import java.io.IOException;
public class MergeSmallFile extends Configured implements Tool {
private static final Log LOG = LogFactory.getLog(MergeSmallFile.class);
private static final long ONE_MB = 1024 * 1024L;
static class TextFileMapper extends
Mapper<LongWritable, Text, Text, NullWritable> {
//
@Override
protected void map(LongWritable key, Text value, Context context)
throws IOException, InterruptedException {
context.write(value, NullWritable.get());
}
}
// 删除原来小文件
protected static void deleteSmallFiles(String deletepath)
throws IOException, InterruptedException {
Configuration conf = new Configuration();
FileSystem fs = FileSystem.get(conf);
Path filePath = new Path(deletepath);
try {
FileStatus[] status = fs.listStatus(filePath);
LOG.info("共有" + status.length + "个文件");
for (FileStatus st : status) {
LOG.info("开始删除:" + st.getPath().getName() + "文件");
fs.delete(st.getPath(), false);
}
fs.delete(filePath, false);
} catch (Exception e) {
e.printStackTrace();
LOG.error(e.getMessage());
}
}
//修改路径
protected static void modifyPath(String src,String dst)
throws IOException, InterruptedException {
Configuration conf = new Configuration();
FileSystem fs = FileSystem.get(conf);
Path srcPath = new Path(src);
Path dstPath = new Path(dst);
try {
fs.rename(srcPath, dstPath);
LOG.info("修改成"+dst+"路径,成功!!!");
} catch (Exception e) {
e.printStackTrace();
LOG.error(e.getMessage());
}
}
public static void main(String[] args) throws Exception {
int exitCode = ToolRunner.run(new MergeSmallFile(), args);
deleteSmallFiles(args[0]);
modifyPath(args[1], args[0]);
System.exit(exitCode);
}
@Override
public int run(String[] args) throws Exception {
Configuration conf = new Configuration(getConf());
String inputDir = args[0];
String outputDir = args[1];
int maxSplitSize = Integer.valueOf(args[2]);
LOG.info("inputDir--->>" + inputDir);
LOG.info("outputDir--->>" + outputDir);
LOG.info("maxSplitSize--->>" + maxSplitSize + "M");
Job job = Job.getInstance(conf);
FileInputFormat.setInputPaths(job, inputDir);
FileOutputFormat.setOutputPath(job, new Path(outputDir));
job.setJarByClass(MergeSmallFile.class);
// 设置最大输入分片大小,与运行的map、及生产的文件数密切相关
CombineTextInputFormat.setMaxInputSplitSize(job, ONE_MB * maxSplitSize);
job.setInputFormatClass(CombineTextInputFormat.class);
job.setOutputFormatClass(TextOutputFormat.class);
job.setOutputKeyClass(Text.class);
job.setMapOutputValueClass(NullWritable.class);
job.setMapperClass(TextFileMapper.class);
job.setNumReduceTasks(0);
return job.waitForCompletion(true) ? 0 : 1;
}
}
可以看到最终结果将三个文件里面的内容合并到一个文件中。注意体会mapreduce.input.fileinputformat.split.maxsize(CombineTextInputFormat.setMaxInputSplitSize)参数的设置,大家可以不设置这个参数并且和设置这个参数运行情况对比,观察Map Task的个数变化。