RDKit入门教程(1)——RDKit 安装 (Win10)

RDKit简介

RDKit官网：https://www.rdkit.org/
RDKit是干啥的：https://www.rdkit.org/docs/Overview.html#what-is-it
言简意赅的翻译一下：

1. RDKit是一个化学信息学的开源工具包
2. 主要用于操作化学分子（SMILES和SMARTS）
3. 可生成适合机器学习的化学分子特征
4. 拥有Python 3.x API和C++ API

Win10下RDKit安装使用（Python API）

1. 下载Anaconda 3.x版本的Python：
   https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2019.07-Windows-x86_64.exe
2. 安装完成后打开Anaconda Prompt: 并在命令行输入以下命令：
   conda create -c rdkit -n my-rdkit-env rdkit
3. 等上述命令完成后，接着激活rdkit的使用环境，进入rdkit模式
   conda activate my-rdkit-env
4. 如果在rdkit环境中需要使用常见模块，请另行使用pip install xxx安装，如：
   pip install numpy
5. 关闭命令行（Anaconda Prompt）窗口。
6. 利用Spyder打开rdkit的文本编辑环境，安装好my-rdkit-env之后，在菜单栏的Anaconda3 (64-bit)文件夹下，应该会出现Spyder (my-rdkit-env)图标，点击即进入有rdkit环境的Spyder，否则会进入base状态的Spyder。

如图所示:

参考资料：https://www.rdkit.org/docs/Install.html