shell中for循环变量常见使用场景

原创已于 2024-03-11 20:08:46 修改

· 690 阅读

0 ·

版权

文章标签：

#技巧 #shell

于 2023-06-13 19:42:34 首次发布

生物信息学专栏收录该内容

54 篇文章

订阅专栏

文章介绍了在Shell脚本中for循环变量的几种常见非典型使用场景，包括在awk条件语句内使用变量$i，以及在文件名生成时变量后跟随字符的情况。示例展示了如何在awk命令中比较字段与for循环变量，并将结果重定向到以变量命名的文件。此外，还提及了处理包含多个字符的变量列表的示例，用于过滤和提取特定字符开头的行。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

shell中for循环变量常见使用场景

1 目的

在shell脚本for循环使用过程中经常出现非常规使用场景，如在awk的条件语句中、输出文本中变量后有字符等，这些场景中需要对for循环中的变量做处理。希望持续完善

2不同场景

2.1 变量在awk内部

变量在awk条件语句内部，用'$i'

for ((i = 1; i <= 22; i++)) 
do
	cat ../../a.txt |awk '{if($5=='$i') print}' > a.top
done

2.2 变量后有字符

for ((i = 1; i <= 22; i++)) 
do
	cat ../../a.txt |awk '{if($5=='$i') print}' > a.$i\top
done
# 或者
for ((i = 1; i <= 22; i++)) 
do
	cat ../../a.txt |awk '{if($5=='$i') print}' > a.${i}_top
done

2.3 变量为字符

chr_list="chr1 chr2 chr3 chr4 chr5 chr6 chr7 chr8 chr9 chr10 chr11 chr12 chr13 chr14 chr15 chr16 chr17 chr18 chr19 chr20 chr21 chr22 chrX chrY chrM"
for  i in $chr_list
do
	cat ${output_dir}tibetan.fpkm.bed|awk '{if($1=="'${i}'") print}'  > ${output_dir}${i}.fpkm.bed
done