MDS(multi-dimensional scaling)

本文介绍如何使用MDS方法从样本距离矩阵恢复样本的相对位置。MDS是一种降维技术,可以将高维数据映射到低维空间,同时尽可能保持样本间的距离不变。通过R语言的`cmdscale`函数实现MDS,适用于多种应用场景。

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在仅知道 样本距离矩阵 的情况下,如何恢复 样本的相对位置?

用MDS方法解决此问题!


1. 推导及MDS过程,参看链接:MDS方法的推导

样本空间的维度 恢复到几维都可以。


2. MDS是一种降维方法:MDS致力于将数据嵌入到一个低维空间,在该低维空间中,样本对之间的距离得到保持。[1]


3. R语言中调用

 library(stats)   
 Xm <- cmdscale(D,k=M)   #D是距离矩阵,k是想要恢复的 样本空间的维度


【参考】

[1] De la Porte J, Herbst B M, Hereman W, et al. An introduction to diffusion maps[C]//Proceedings of the 19th Symposium of the Pattern Recognition Association of South Africa (PRASA 2008), Cape Town, South Africa. 2008: 15-25.

[2] An Introduction to MDS (FLORIAN WICKELMAIER) 

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