开源有限元分析软件-Elmer FEM 开发教程 (2)Elmer FEM 环境搭建

本章为 Elmer FEM 的二次开发提供了一个详细的环境搭建指南,涵盖安装依赖项、获取源代码、编译软件以及验证安装的步骤。Elmer FEM 是一个开源的多物理场有限元分析软件,广泛应用于工程和科学研究。二次开发需要从源代码编译软件,以便修改或扩展其功能。本章提供适用于 Linux、Windows 和 macOS 的详细步骤,适合初学者和经验丰富的开发者。通过代码示例和说明,您将能够快速设置开发环境并为后续开发做好准备。

2.1 引言

在进行 Elmer FEM 的二次开发之前,您需要设置一个开发环境,以便从源代码编译软件并进行修改。Elmer FEM 是一个基于 C++ 和 Fortran 的开源软件,支持多种物理模型和并行计算。二次开发可能涉及创建自定义求解器、修改现有模型或集成其他工具。本章将指导您完成以下步骤:

  • 安装必要的编译器和工具。
  • 获取 Elmer FEM 源代码。
  • 配置和编译软件。
  • 验证安装是否成功。

本章适用于 Linux(推荐 Ubuntu)、Windows 和 macOS 平台,确保初学者和进阶开发者都能轻松上手。

2.2 系统要求

要成功设置 Elmer FEM 的开发环境,您的系统需要满足以下要求:

要求描述
操作系统Linux(推荐 Ubuntu 20.04 或更高版本)、Windows 10/11 或 macOS。
编译器支持 C++ 和 Fortran 的编译器,如 GCC(g++、gfortran)、MSVC 或 Clang。
CMake版本 3.10 或更高,用于构建项目。
Git用于克隆 Elmer FEM 源代码仓库。
依赖项BLAS、LAPACK(线性代数库),MPI(用于并行计算,可选)。
可选依赖OpenCascade、QWT(用于 ElmerGUI),ParaView(用于后处理)。

硬件建议

  • CPU:多核处理器(推荐 4 核或更多,特别是在并行计算时)。
  • 内存:至少 8GB(大型模拟可能需要更多)。
  • 存储:至少 10GB 可用空间(包括源代码和编译文件)。

2.3 安装依赖项

根据您的操作系统,安装以下依赖项:

2.3.1 Linux(Ubuntu)

在 Ubuntu 上,使用 apt-get 安装必要的工具和库:

sudo apt-get update
sudo apt-get install build-essential cmake git libblas-dev liblapack-dev libopenmpi-dev
  • build-essential:包含 GCC、g++ 和 gfortran。
  • cmake:构建系统。
  • git:版本控制工具。
  • libblas-dev、liblapack-dev:线性代数库。
  • libopenmpi-dev:MPI 库,用于并行计算(可选)。

如果需要编译 ElmerGUI,还需安装以下依赖:

sudo apt-get install libopencascade-dev libqwt-dev
2.3.2 Windows

在 Windows 上,您需要:

  1. 安装 Visual Studio
  2. 安装 CMake
  3. 安装 Git
  4. 安装 BLAS 和 LAPACK
    • 使用 Intel MKL 或 OpenBLAS(推荐通过 MSYS2 安装)。
    • 示例(MSYS2):
      pacman -S mingw-w64-x86_64-openblas
      
  5. 安装 MPI(可选)
2.3.3 macOS

在 macOS 上,使用 Homebrew 安装依赖:

brew install gcc cmake git openblas open-mpi
  • gcc:包含 g++ 和 gfortran。
  • cmake:构建系统。
  • git:版本控制工具。
  • openblas:BLAS 和 LAPACK 实现。
  • open-mpi:MPI 库(可选)。

如果需要 ElmerGUI,安装:

brew install opencascade qwt

2.4 获取 Elmer FEM 源代码

Elmer FEM 的源代码托管在 GitHub 上。使用 Git 克隆仓库:

git clone https://github.com/ElmerCSC/elmerfem.git
cd elmerfem

注意

  • 使用 --recursive 选项确保克隆所有子模块:
    git clone --recursive https://github.com/ElmerCSC/elmerfem.git
    
  • 如果已克隆但未包含子模块,运行:
    git submodule update --init --recursive
    

2.5 编译 Elmer FEM

Elmer FEM 使用 CMake 构建系统。以下是编译步骤:

2.5.1 创建构建目录

在 Elmer FEM 根目录下创建构建目录:

mkdir build
cd build
2.5.2 配置 CMake

运行 CMake 配置构建选项:

cmake -DWITH_ELMERGUI:BOOL=FALSE -DWITH_MPI:BOOL=FALSE -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=…/install …/elmerfem

  • 选项说明
    • -DWITH_ELMERGUI:BOOL=FALSE:禁用 ElmerGUI 编译(若需要 GUI,设为 TRUE)。
    • -DWITH_MPI:BOOL=FALSE:禁用 MPI 支持(若需要并行计算,设为 TRUE)。
    • -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=../install:指定安装路径(可自定义,如 /usr/local/Elmer-devel)。

如果 CMake 无法找到依赖项(如 BLAS 或 LAPACK),手动指定路径:

cmake -DCMAKE_PREFIX_PATH=/path/to/dependency ../elmerfem

您也可以使用图形化工具配置:

ccmake .

cmake-gui .
2.5.3 编译和安装

编译源代码:

make
make install

Windows 特定步骤

  1. 使用 CMake 生成 Visual Studio 项目文件:
    cmake -G "Visual Studio 16 2019" -A x64 ../elmerfem
    
  2. 打开生成的 .sln 文件,使用 Visual Studio 编译。

2.6 设置环境变量

为方便使用 Elmer FEM 的可执行文件和库,设置以下环境变量:

  • Linux/macOS
    ~/.bashrc~/.zshrc 中添加:

    export ELMER_HOME=/path/to/install
    export PATH=$PATH:$ELMER_HOME/bin
    export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$ELMER_HOME/lib
    

    然后运行:

    source ~/.bashrc
    
  • Windows
    在系统环境变量中设置:

    • ELMER_HOME = C:\path\to\install
    • PATH = %PATH%;%ELMER_HOME%\bin;%ELMER_HOME%\lib

2.7 验证安装

编译完成后,运行测试用例验证安装:

cd ../tests
./runtests.sh

如果测试通过,说明 Elmer FEM 已正确安装。

2.8 开发工具建议

为方便二次开发,推荐以下工具:

  • 文本编辑器:Visual Studio Code、Emacs 或 Vim,用于编辑 Fortran、C++ 和 XML 文件。
  • 版本控制:初始化 Git 仓库管理自定义代码:
    git init
    
  • 调试工具:GDB 或 Visual Studio 的调试器。

2.9 目录结构

安装完成后,Elmer FEM 的目录结构如下:

目录内容
bin可执行文件(如 ElmerSolverElmerGrid)。
lib库文件(如求解器模块)。
share文档、教程和 EDF 文件(用于 ElmerGUI)。
include头文件,用于开发自定义求解器。

2.10 注意事项

  • 依赖项兼容性:确保 BLAS 和 LAPACK 的版本与编译器兼容。
  • 权限问题:在 Linux 上,可能需要 sudo 权限进行安装。
  • ElmerGUI:如果需要 GUI,确保安装 OpenCascade 和 QWT。
  • 并行计算:启用 MPI 需要正确配置 MPI 库。
  • 社区支持:如遇问题,可访问 Elmer 讨论论坛 获取帮助。

2.11 总结

本章详细介绍了如何为 Elmer FEM 的二次开发设置开发环境,包括安装依赖项、获取源代码、编译和验证安装。通过提供的代码示例,您可以快速在 Linux、Windows 或 macOS 上完成环境搭建。下一章将介绍 Elmer FEM 的架构和基本概念,为后续开发奠定基础。

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