python ipynb中运行 报错rpy2 UsageError: Cell magic `%%R` not found.，原因是命令行要用raw的格式

python ipynb中运行 报错rpy2 UsageError: Cell magic %%R not found.，原因是命令行要用raw的格式

import rpy2.ipython
print(rpy2.ipython.file)
c:\Users\Administrator\conda\envs\python2025-9-19\Lib\site-packages\rpy2\ipython_init_.py

%%R
library(SoupX)
UsageError: Cell magic %%R not found.

解决

其他

模块存在，但 “存在” ≠ “已加载魔法”。
%%R 是 IPython 魔法命令，必须显式注册到当前内核，否则 Jupyter 根本认不出它。

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✅ 正确顺序（再强调一次）

1. 先执行（Python 单元格）：

   %load_ext rpy2.ipython
   

   看到 In [x]: 没报错就行。

2. 再新开单元格（语言选“Raw”或直接输入）：

   %%R
   library(SoupX)
   

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❗ 你现在的做法

• 只 import rpy2.ipython → 只是导入模块，没有注册魔法。
• 所以下一行 %%R 仍会被 Jupyter 当成“不认识的魔法”，抛出 UsageError。

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✅ 一句话

import 不等于 %load_ext；
必须先 %load_ext rpy2.ipython，%%R 才会被识别。