AnnData对象包含以下主要部分:
- X:基因表达矩阵
- obs:细胞元数据(观测数据)
- var:基因元数据(变量数据)
- uns:未分类数据(杂项数据)
- obsm:多维细胞元数据
- varm:多维基因元数据
- layers:不同层的数据
生成对象代码
import numpy as np
import pandas as pd
import scanpy as sc
from anndata import AnnData
# 生成随机的基因表达数据
num_cells = 100 # 细胞数量
num_genes = 200 # 基因数量
# 生成一个随机的表达矩阵