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原创 新电脑到手要干的事情
这里写自定义目录标题WindowsLinuxWindowsLantern windowsCopytranslator windowsStretchly windows 选Stretchly-Setup.exe坚果云 windows百度网盘 windowsXshellXftp钉钉 windowsLinuxlantern Linux搜狗输入法Linux坚果云Linux钉钉Linux 选 amd64.debxmind LinuxVscode Linuxsublime text百
2021-01-14 09:32:41
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原创 程序员提升工作效率和质量工具
通用1. 能用快捷键就用快捷键终端1. moshssh登录替代品，网络断开，也不会连接中断。2. tmux用于终端各种便捷操作3. lynx用于便捷浏览操作linux文件系统4. 学会使用不用输密码的方式登陆比如github, gitlab, ssh远程登录，数据库远程登录等等。桌面1. 学会使用虚拟桌面数据库1. pspg - Postgres Pager2. DBvisualizer...
2020-09-04 21:25:42
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原创 Windows更换Conda镜像
比如我的就在：C:\Users\zhoudx.condarc。位置一般都在C盘，用户目录下，你的账号那个文件夹里面。我喜欢直接修改.condarc文件。就清华源好用，其他源都不太稳定。
2025-02-06 12:25:57
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原创 免费企业域名备案手把手教程
主办者负责人，当前登录的阿里云账户的人，不是企业法人的话，得准备委托书，会有地方提供模板，打印一下，签字扫描上传就行。走到下面这一步，剩下的在手机上操作，就是下载阿里云APP，把下面需要的资料，弄成图片保存在相册里，依次上传就行。在负责人的阿里云账号下，搞个阿里云服务器，云服务选择ECS, 就可以选择云产品实例。接下来没有特别要说明的，自己看着往下走就行。
2024-06-02 16:19:39
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原创 OSError: (External) CUDA error(222), the provided PTX was compiled with an unsupported toolchain..
安装了CUDA 10.1, 11.1, 11.3, 11.4, 11.8, 12.0都不行。检查一下已经安装的NVIDIA驱动，返回为空的话，说明没有驱动，直接跳过这一步。本来的驱动 NVIDIA 470。
2023-09-22 15:04:40
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原创 PyTorch Error: Expected more than 1 value per channel when training
python import parent directory
2022-08-24 17:02:21
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原创 基于结构的虚拟筛选模型 gnina 从源码编译
所需要的软件安装包：安装 CUDA装的时候看着点，第二个要你装驱动的选择，回答N，不装。sudo sh cuda_10.0.130_410.48_linux.runsudo vim ~/.bashrc在 ~/.bashrc 文件最后加上export PATH=/usr/bin:/usr/local/cuda-10.0/bin${PATH}export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-10.0/lib64:${LD_LIBRARY_PATH}source ~
2022-04-13 10:26:27
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原创 Ubuntu 20.04 安装 CUDA10.0和cudnn7.6
Install CUDAcuda 10.0Download cuda 10装的时候看着点，第二个要你装驱动的选择，回答N，不装。sudo sh cuda_10.0.130_410.48_linux.runsudo vim ~/.bashrcadd the following lines to the end of the file ~/.bashrcexport PATH=/usr/bin:/usr/local/cuda-10.0/bin${PATH}export LD_LIBRARY
2022-04-12 19:02:54
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原创 Ubuntu 20.04 安装CUDA11.1 和cudnn 8.0.5
Install CUDAcuda 11.1百度网盘链接密码: bo6fsudo sh cuda_10.0.130_410.48_linux.run安装成功后跳出============ Summary ============Driver: Not SelectedToolkit: Installed in /usr/local/cuda-11.1/Samples: Not SelectedPlease make sure that - PATH includes
2022-04-12 12:54:29
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原创 Could NOT find OpenSSL, try to set the path to OpenSSL root folder in the system variable
sudo apt install libssl-dev
2022-04-07 11:41:26
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原创 ubuntu 20.04 源码编译 cmake
sudo apt install cmake 无法安装最新的cmake，只能从源码编译https://www.linuxcapable.com/install-cmake-on-ubuntu-20-04-lts/https://askubuntu.com/questions/355565/how-do-i-install-the-latest-version-of-cmake-from-the-command-line
2022-04-07 11:33:56
529
原创 使用MOE进行药效团建模与分析
参考YouTube ligand-based 药效团建模 pharmacophore elucidateStructure-basd 药效团建模 PLIF
2022-03-25 10:53:58
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原创 PyTorch nn.GRU 使用详解
我们看官方文档一些参数介绍，以及如下一个简单例子：看完之后，还是一脸懵逼: 输入什么鬼？ 输出又什么鬼？(这里我先把官网中 h0 去掉了，便于大家先理解更重要的概念)import torchfrom torch import nnrnn = nn.GRU(10, 20, 2)input = torch.randn(5, 3, 10)output, hn = rnn(input)运行之后，各变量的shape如下:要使用GRU这个layer，就要明白，要先定义GRU，然后才是调用这个定义
2022-03-16 19:23:07
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原创 PostgreSQL 给数据库添加用户
进入 PostgreSQL后创建一个 davide 用户，并设置密码’jw8s0F4’;CREATE USER davide WITH PASSWORD 'jw8s0F4';把名为chembl_29的数据库的权限都给这个新创建的用户 davidegrant all privileges on database chembl_29 to davide;用新创建的用户访问名为chembl_29的数据库davide$ psql chembl_29...
2022-03-14 11:04:58
3097
原创 PostgreSQL Pattern Matching
https://www.postgresql.org/docs/8.3/functions-matching.html
2022-01-18 15:19:18
366
原创 ubuntu 导入 chembl 29 dmp 文件进入postgresql
Install PostgreSQL 10sudo sh -c 'echo "deb http://apt.postgresql.org/pub/repos/apt $(lsb_release -cs)-pgdg main" > /etc/apt/sources.list.d/pgdg.list'wget --quiet -O - https://www.postgresql.org/media/keys/ACCC4CF8.asc | sudo apt-key add -sudo apt-get
2022-01-17 19:44:06
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原创 手把手教程 Sublime Text 删除重复行
按 ctrl + hFind里面输入^(.+)$[\r\n](^\1$[\r\n]{0, 1})+Replace里面输入\1\n打开正则开关，左下角的点亮开始不一样了这时候选择 Replace All, 就删掉重复行了哦
2021-12-24 14:51:00
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1
原创 Ubuntu 使用 Smina 对接教程
安装 PyMOL参考这篇安装 OpenBabelsudo apt-get install openbabel -y需要用的软件都已经安装好了，现在你就可以看官网中的教程了，跟着做就好https://www.cheminformania.com/ligand-docking-with-smina/
2021-12-01 17:07:58
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原创 使用 PyMOL 将靶点与配体复合物中的靶点和配体拆出来
文章目录一、打开 PyMOL二、开始表演依次在 pymol 中间的框框里输入下面的命令一、打开 PyMOLubuntu 安装 pymol 教程二、开始表演依次在 pymol 中间的框框里输入下面的命令fetch 1OYTremove resn HOHh_add elem O or elem Nselect 1OYT-FSN, resn FSN #Create a selection called 1OYT-FSN from the ligandselect 1OYT-receptor, 1
2021-12-01 16:36:27
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原创 ubuntu 安装 最新 PyMOL [源码安装][免费]
一、安装依赖包sudo apt-get updatesudo apt-get install -y git build-essential python3-dev libglew-dev \ libpng-dev libfreetype6-dev libxml2-dev \ libmsgpack-dev python3-pyqt5.qtopengl libglm-dev libnetcdf-dev二、下载源代码如果下面两个命令使用不了的话，直接进入网址去下载，Download ZI
2021-12-01 16:11:09
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原创 docker 常用命令
Logindocker login -u user -p passwdPulldocker pull docker.yfish.x/fergie:v1.0.0Pushdocker push docker.yfish.x/gninaRundocker run -it --pid=host --gpus all --mount type=bind,src=/y/,dst=/y/ gnina/gninaUseful commandCommandDescrtiptiondoc
2021-11-26 14:51:26
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原创 可以记录阅读进度的 pdf 电脑阅读器
亚马逊的 kindle pc端具有 阅读记录进度功能，唯一的缺点就是不能上下滑动看pdf，只能一页一页的翻的看百度云链接：https://pan.baidu.com/s/1dRrVezJkqu3FWzg88744mg提取码：t5r5官网下载官网不一定进得去https://www.amazon.com/Amazon-Digital-Services-LLC-Download/dp/B00UB76290...
2021-11-16 20:54:26
1425
空空如也
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